55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2903 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 839 aa  1713    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  35.71 
 
 		 801 aa  398  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  34.32 
 
 		 793 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  31.57 
 
 		 819 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  30.24 
 
 		 796 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  31.61 
 
 		 787 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  31.4 
 
 		 775 aa  312  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  30.17 
 
 		 796 aa  312  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 		 793 aa  241  4e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  28.22 
 
 		 836 aa  238  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  27.08 
 
 		 805 aa  218  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  27.3 
 
 		 826 aa  191  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  30.2 
 
 		 955 aa  168  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.15 
 
 		 1187 aa  138  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  30.34 
 
 		 949 aa  137  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  23.91 
 
 		 728 aa  119  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  26.7 
 
 		 1188 aa  110  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  27.9 
 
 		 1118 aa  104  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  22.5 
 
 		 734 aa  99  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  22.51 
 
 		 734 aa  97.4  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  24.29 
 
 		 910 aa  95.9  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  23.24 
 
 		 572 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  24.03 
 
 		 757 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  22.82 
 
 		 770 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  24.2 
 
 		 831 aa  81.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  21.93 
 
 		 733 aa  75.5  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  21.63 
 
 		 876 aa  74.3  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  23.21 
 
 		 936 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  26.8 
 
 		 856 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  25.46 
 
 		 568 aa  67.8  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  21.04 
 
 		 553 aa  68.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  23.96 
 
 		 883 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  20 
 
 		 1251 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  20.56 
 
 		 585 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  39.29 
 
 		 763 aa  60.8  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  23.44 
 
 		 901 aa  61.2  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  18.3 
 
 		 923 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  21.99 
 
 		 1107 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  20.05 
 
 		 935 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  19.5 
 
 		 755 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  23.56 
 
 		 776 aa  52.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  18.4 
 
 		 951 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  18.54 
 
 		 897 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  20.23 
 
 		 895 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  25.36 
 
 		 1061 aa  48.5  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  20.72 
 
 		 931 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  19.69 
 
 		 774 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  23.21 
 
 		 851 aa  45.8  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  25.25 
 
 		 657 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  27.01 
 
 		 681 aa  45.8  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.67 
 
 		 1507 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  22.05 
 
 		 941 aa  45.4  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.13 
 
 		 676 aa  45.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  20.27 
 
 		 899 aa  44.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  20.52 
 
 		 941 aa  44.3  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>