83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6131 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  51.39 
 
 		 757 aa  756    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 755 aa  1576    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  44.85 
 
 		 733 aa  625  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  24.89 
 
 		 1107 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  25.17 
 
 		 728 aa  104  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  23.93 
 
 		 910 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  22.12 
 
 		 894 aa  99.8  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  24.53 
 
 		 916 aa  97.4  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  26.17 
 
 		 1188 aa  95.5  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  25.11 
 
 		 910 aa  93.6  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  21.8 
 
 		 734 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  25.59 
 
 		 1187 aa  91.3  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  34.62 
 
 		 951 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  23.42 
 
 		 734 aa  88.2  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  24.93 
 
 		 941 aa  82  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  25.3 
 
 		 851 aa  82  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  26.15 
 
 		 1118 aa  81.6  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  22.87 
 
 		 856 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  23.24 
 
 		 916 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  24.86 
 
 		 1507 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  25.55 
 
 		 935 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  25 
 
 		 774 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  24.79 
 
 		 1084 aa  76.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  23.1 
 
 		 918 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  23.08 
 
 		 883 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  23.03 
 
 		 1251 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  29.3 
 
 		 926 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  27.24 
 
 		 801 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  25.95 
 
 		 757 aa  70.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  24.49 
 
 		 763 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  22.88 
 
 		 793 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  26.45 
 
 		 855 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  39.33 
 
 		 904 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  23.28 
 
 		 844 aa  68.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  24.05 
 
 		 829 aa  67.4  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  30.77 
 
 		 1021 aa  67.4  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  24.51 
 
 		 776 aa  66.6  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  25.29 
 
 		 872 aa  64.3  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  24.38 
 
 		 796 aa  64.3  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  23.92 
 
 		 770 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  23.16 
 
 		 909 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  23.77 
 
 		 895 aa  62  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  27.64 
 
 		 901 aa  61.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  22.84 
 
 		 910 aa  61.2  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  25.62 
 
 		 941 aa  60.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  24.51 
 
 		 796 aa  60.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  21.88 
 
 		 880 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  24.36 
 
 		 899 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  22.79 
 
 		 832 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  23.83 
 
 		 819 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  20.52 
 
 		 793 aa  58.2  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  24.64 
 
 		 831 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  22.22 
 
 		 826 aa  57.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  20.54 
 
 		 787 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  20.35 
 
 		 876 aa  56.2  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  20.33 
 
 		 860 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  26.87 
 
 		 936 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  22.59 
 
 		 1429 aa  55.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  19.5 
 
 		 839 aa  55.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  22.92 
 
 		 931 aa  54.3  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  21.95 
 
 		 955 aa  54.3  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  30.11 
 
 		 868 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  21.85 
 
 		 860 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  23.08 
 
 		 774 aa  52.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  21.52 
 
 		 860 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  21.62 
 
 		 873 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.49 
 
 		 914 aa  50.8  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  21.52 
 
 		 860 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  24.09 
 
 		 971 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  20.22 
 
 		 773 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  19.58 
 
 		 923 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  22.02 
 
 		 775 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  26.27 
 
 		 1061 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  25.26 
 
 		 859 aa  48.9  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  21.29 
 
 		 776 aa  48.9  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  22.44 
 
 		 836 aa  48.5  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  22.65 
 
 		 805 aa  48.1  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  21.97 
 
 		 831 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  34.44 
 
 		 568 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  32.03 
 
 		 706 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  22.69 
 
 		 897 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  21.77 
 
 		 585 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.25 
 
 		 781 aa  45.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>