98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1575 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  49.37 
 
 		 712 aa  715    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  55.99 
 
 		 657 aa  770    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  57.34 
 
 		 662 aa  778    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  58.42 
 
 		 674 aa  801    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  100 
 
 		 681 aa  1384    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  55.99 
 
 		 657 aa  770    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  48.38 
 
 		 672 aa  599  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  47.82 
 
 		 657 aa  571  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  43.32 
 
 		 663 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  43.45 
 
 		 655 aa  499  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  40.39 
 
 		 659 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  39.17 
 
 		 661 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  41.96 
 
 		 668 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  41.13 
 
 		 661 aa  458  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  39.97 
 
 		 663 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  38.41 
 
 		 660 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  40.51 
 
 		 678 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  38.19 
 
 		 659 aa  425  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  40.06 
 
 		 675 aa  422  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  40.42 
 
 		 678 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  38.51 
 
 		 687 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  37.92 
 
 		 686 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  41.19 
 
 		 692 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  38.36 
 
 		 652 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  40.86 
 
 		 693 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  35.57 
 
 		 659 aa  399  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  41.27 
 
 		 693 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  34.7 
 
 		 672 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.31 
 
 		 659 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  38.31 
 
 		 610 aa  389  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  35.23 
 
 		 672 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  38.55 
 
 		 641 aa  365  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.08 
 
 		 662 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  33.73 
 
 		 651 aa  360  6e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  37.44 
 
 		 660 aa  355  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  35.2 
 
 		 720 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  29.07 
 
 		 614 aa  273  8.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  29.47 
 
 		 611 aa  268  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  28.49 
 
 		 658 aa  254  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.28 
 
 		 651 aa  254  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.68 
 
 		 565 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.12 
 
 		 656 aa  226  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.35 
 
 		 1433 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  24.35 
 
 		 1593 aa  101  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  23.05 
 
 		 1526 aa  81.6  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  23.87 
 
 		 1537 aa  75.1  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.56 
 
 		 725 aa  71.2  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.72 
 
 		 700 aa  64.7  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.38 
 
 		 741 aa  63.9  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.24 
 
 		 741 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.88 
 
 		 723 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.36 
 
 		 724 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.85 
 
 		 720 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.21 
 
 		 751 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.74 
 
 		 760 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25 
 
 		 733 aa  56.2  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.37 
 
 		 721 aa  55.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.63 
 
 		 734 aa  54.7  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.76 
 
 		 732 aa  54.3  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.33 
 
 		 741 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.08 
 
 		 731 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.28 
 
 		 736 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  23.83 
 
 		 675 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.83 
 
 		 776 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.83 
 
 		 776 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  24.35 
 
 		 758 aa  52  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.69 
 
 		 708 aa  52  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.83 
 
 		 797 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.83 
 
 		 770 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  23.83 
 
 		 770 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.25 
 
 		 711 aa  51.2  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  29.63 
 
 		 826 aa  51.2  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.19 
 
 		 612 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  23.45 
 
 		 757 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.82 
 
 		 723 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.84 
 
 		 720 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.51 
 
 		 734 aa  49.3  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.08 
 
 		 732 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.75 
 
 		 716 aa  49.3  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1137  hypothetical protein  22.74 
 
 		 444 aa  48.9  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0252196  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.5 
 
 		 735 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.48 
 
 		 717 aa  48.5  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.61 
 
 		 736 aa  48.5  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.31 
 
 		 623 aa  48.5  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.64 
 
 		 734 aa  47.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.81 
 
 		 729 aa  47.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.28 
 
 		 757 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  23.87 
 
 		 706 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.15 
 
 		 746 aa  47.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.74 
 
 		 740 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  27.01 
 
 		 839 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.87 
 
 		 741 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  23.19 
 
 		 723 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.99 
 
 		 868 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.99 
 
 		 726 aa  44.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.51 
 
 		 759 aa  44.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.98 
 
 		 733 aa  44.3  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.63 
 
 		 734 aa  43.9  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>