58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3681 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 949 aa  1862    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  46.59 
 
 		 955 aa  769    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  25.15 
 
 		 734 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  24.49 
 
 		 734 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  23.62 
 
 		 728 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  30.02 
 
 		 801 aa  153  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  30.56 
 
 		 839 aa  147  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  25.96 
 
 		 793 aa  134  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  30.22 
 
 		 826 aa  132  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  26.08 
 
 		 775 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  25.91 
 
 		 819 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  24.71 
 
 		 787 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  25.93 
 
 		 796 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  26.63 
 
 		 796 aa  121  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  25.58 
 
 		 936 aa  119  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  23.59 
 
 		 1187 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 		 793 aa  117  7.999999999999999e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  23.42 
 
 		 836 aa  114  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  25.57 
 
 		 805 aa  112  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  23.19 
 
 		 770 aa  99  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  22.44 
 
 		 572 aa  99  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  27.44 
 
 		 883 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  30.28 
 
 		 856 aa  87.8  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  26.99 
 
 		 1118 aa  86.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  22.76 
 
 		 585 aa  84.3  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  24.9 
 
 		 1188 aa  82  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  21.18 
 
 		 831 aa  80.9  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  26.42 
 
 		 910 aa  80.9  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  29.47 
 
 		 831 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  24.13 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  26.63 
 
 		 568 aa  74.3  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  25.49 
 
 		 910 aa  72  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  26.29 
 
 		 1107 aa  65.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  23.39 
 
 		 918 aa  64.7  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  26.3 
 
 		 774 aa  64.3  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  20.64 
 
 		 882 aa  62.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  21.85 
 
 		 733 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  26.96 
 
 		 901 aa  60.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  26.37 
 
 		 757 aa  59.7  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  24.86 
 
 		 941 aa  59.7  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  21.78 
 
 		 897 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  21.82 
 
 		 923 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  24.33 
 
 		 776 aa  55.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  23.45 
 
 		 941 aa  55.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  26.77 
 
 		 829 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  25.37 
 
 		 872 aa  54.7  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  26.44 
 
 		 761 aa  54.3  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  24.77 
 
 		 895 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  20.97 
 
 		 774 aa  51.2  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  25.05 
 
 		 899 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  24.7 
 
 		 810 aa  48.1  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  21.17 
 
 		 909 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  21.44 
 
 		 916 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  25.08 
 
 		 755 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  30.99 
 
 		 935 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  20.95 
 
 		 910 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.26 
 
 		 1507 aa  44.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  24.29 
 
 		 905 aa  44.3  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>