73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1874 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  47.44 
 
 
909 aa  847    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  52.63 
 
 
941 aa  900    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  40.65 
 
 
860 aa  669    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  46.26 
 
 
904 aa  806    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 
895 aa  1829    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  85.35 
 
 
899 aa  1596    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  53.39 
 
 
935 aa  910    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  47.79 
 
 
1061 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  42.51 
 
 
941 aa  667    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  41.36 
 
 
951 aa  740    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  40.89 
 
 
860 aa  674    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  42.59 
 
 
971 aa  683    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  41.36 
 
 
860 aa  679    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  40.77 
 
 
860 aa  674    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  46.95 
 
 
918 aa  801    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  43.49 
 
 
931 aa  627  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  35.37 
 
 
916 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  37.92 
 
 
1251 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  44.16 
 
 
868 aa  615  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  45.34 
 
 
829 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  41.87 
 
 
901 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  35.46 
 
 
910 aa  570  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  35.96 
 
 
894 aa  558  1e-157  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  42.12 
 
 
859 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  36.29 
 
 
876 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  39.58 
 
 
855 aa  539  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  41.64 
 
 
851 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  37.06 
 
 
905 aa  531  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  41.56 
 
 
880 aa  528  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.113833 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  38.56 
 
 
1507 aa  526  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  39.61 
 
 
872 aa  522  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  40.3 
 
 
844 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  39.89 
 
 
832 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  40.98 
 
 
763 aa  512  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  41.43 
 
 
757 aa  512  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  36.78 
 
 
1429 aa  507  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  33.15 
 
 
916 aa  502  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  32.23 
 
 
926 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  35.15 
 
 
858 aa  478  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  36.62 
 
 
1084 aa  479  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  37.89 
 
 
873 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  38.45 
 
 
776 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  34.67 
 
 
1107 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  38.18 
 
 
773 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  38.9 
 
 
774 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  37.98 
 
 
776 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  35.59 
 
 
910 aa  445  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  28.25 
 
 
923 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  31.49 
 
 
774 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  26.54 
 
 
914 aa  261  5.0000000000000005e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  28.53 
 
 
761 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  26.76 
 
 
910 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  22.18 
 
 
882 aa  203  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.97 
 
 
1187 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  22.98 
 
 
1188 aa  87.4  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  23.99 
 
 
1118 aa  86.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  24.12 
 
 
734 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  22.58 
 
 
757 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.38 
 
 
733 aa  71.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  27.55 
 
 
826 aa  71.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  21.89 
 
 
728 aa  68.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  23.02 
 
 
770 aa  67.8  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  23.77 
 
 
755 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  22.24 
 
 
734 aa  61.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  26.46 
 
 
936 aa  61.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  22.22 
 
 
793 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  30.05 
 
 
955 aa  54.3  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  21.22 
 
 
801 aa  52.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  28.38 
 
 
1021 aa  51.6  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  20.23 
 
 
839 aa  48.9  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  27.72 
 
 
949 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  40.28 
 
 
1037 aa  45.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  27.12 
 
 
657 aa  44.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>