60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1049 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 882 aa  1821    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  23.91 
 
 		 941 aa  258  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  26.28 
 
 		 894 aa  253  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  26.52 
 
 		 926 aa  252  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  25.46 
 
 		 774 aa  250  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  26.24 
 
 		 1084 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  24.71 
 
 		 860 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  26.96 
 
 		 923 aa  241  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  24.37 
 
 		 860 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  24.43 
 
 		 860 aa  235  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  24.54 
 
 		 860 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  26.8 
 
 		 916 aa  233  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  24.66 
 
 		 910 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  23.53 
 
 		 918 aa  218  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  22.27 
 
 		 935 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  25.09 
 
 		 876 aa  213  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  24.37 
 
 		 909 aa  207  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  23.62 
 
 		 904 aa  206  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  21.89 
 
 		 899 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  22.18 
 
 		 895 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  23.9 
 
 		 868 aa  201  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  24.39 
 
 		 1251 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  23.38 
 
 		 931 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  23.06 
 
 		 1061 aa  195  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  24.31 
 
 		 776 aa  195  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  23.69 
 
 		 916 aa  194  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  21.44 
 
 		 971 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  22.84 
 
 		 1507 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  23.17 
 
 		 941 aa  185  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  23.66 
 
 		 910 aa  185  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  23.13 
 
 		 851 aa  181  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  24.09 
 
 		 1107 aa  180  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  21.7 
 
 		 855 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  22.33 
 
 		 905 aa  175  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  23.27 
 
 		 776 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  24.28 
 
 		 858 aa  171  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.37 
 
 		 1429 aa  170  9e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  23.95 
 
 		 880 aa  170  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  23.6 
 
 		 763 aa  169  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  22.32 
 
 		 951 aa  164  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  22.65 
 
 		 832 aa  163  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  23.22 
 
 		 773 aa  164  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  22.62 
 
 		 829 aa  163  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  20.74 
 
 		 844 aa  161  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  20.45 
 
 		 901 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  21.06 
 
 		 757 aa  151  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  21.58 
 
 		 859 aa  149  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  22.64 
 
 		 774 aa  145  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  20.57 
 
 		 872 aa  137  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  19.77 
 
 		 873 aa  132  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  22.76 
 
 		 761 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  22.83 
 
 		 914 aa  122  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  23.67 
 
 		 770 aa  74.3  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  20.35 
 
 		 1118 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  21.44 
 
 		 1188 aa  58.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  20.69 
 
 		 955 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  19.92 
 
 		 949 aa  54.7  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  25.2 
 
 		 734 aa  48.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  20.21 
 
 		 801 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  19.12 
 
 		 796 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>