68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0430 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  42.43 
 
 		 1429 aa  650    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  52.4 
 
 		 855 aa  795    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  53.33 
 
 		 931 aa  781    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  45.22 
 
 		 935 aa  678    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  49.87 
 
 		 774 aa  636    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  49.59 
 
 		 872 aa  723    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  53.37 
 
 		 859 aa  776    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  59.06 
 
 		 880 aa  904    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  50.86 
 
 		 763 aa  702    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  43.96 
 
 		 941 aa  655    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  51.41 
 
 		 829 aa  673    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 844 aa  1681    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  49.47 
 
 		 851 aa  638    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  55.08 
 
 		 757 aa  722    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  53.37 
 
 		 901 aa  756    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  41.38 
 
 		 905 aa  653    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  44.8 
 
 		 1507 aa  707    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  48.01 
 
 		 832 aa  641    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  41.27 
 
 		 918 aa  634  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  40.02 
 
 		 904 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  39.43 
 
 		 909 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  41.02 
 
 		 858 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  39.51 
 
 		 941 aa  548  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  34.59 
 
 		 860 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  33.69 
 
 		 860 aa  528  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  39.19 
 
 		 899 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  34.31 
 
 		 860 aa  525  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  40.3 
 
 		 895 aa  521  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  32.98 
 
 		 860 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  38.09 
 
 		 910 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  40.44 
 
 		 773 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  44.54 
 
 		 1061 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  39.18 
 
 		 776 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  33.07 
 
 		 951 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  39.49 
 
 		 868 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.63 
 
 		 894 aa  429  1e-118  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  40.45 
 
 		 971 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  38.58 
 
 		 776 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  41.12 
 
 		 873 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  31.51 
 
 		 876 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  30.04 
 
 		 910 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  35.89 
 
 		 1084 aa  364  3e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  29.59 
 
 		 1251 aa  357  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  28.55 
 
 		 916 aa  342  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  32.11 
 
 		 1107 aa  323  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  26.1 
 
 		 926 aa  313  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  28.05 
 
 		 916 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  26.52 
 
 		 923 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  31.02 
 
 		 774 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  28.18 
 
 		 761 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.33 
 
 		 914 aa  173  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  20.74 
 
 		 882 aa  161  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  25.25 
 
 		 910 aa  117  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  21.91 
 
 		 733 aa  89  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  24.03 
 
 		 734 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  23.77 
 
 		 1118 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  22.92 
 
 		 728 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  24.6 
 
 		 1188 aa  71.2  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  25.49 
 
 		 955 aa  68.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  23.28 
 
 		 755 aa  68.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  23.89 
 
 		 801 aa  58.9  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  22.94 
 
 		 883 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  23.79 
 
 		 1187 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  22.47 
 
 		 572 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.34 
 
 		 757 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  22.24 
 
 		 831 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  24.23 
 
 		 770 aa  51.2  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  22.79 
 
 		 775 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>