61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG00310 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  42.68 
 
 		 905 aa  679    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  46.68 
 
 		 1429 aa  752    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  44.61 
 
 		 931 aa  653    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  46.31 
 
 		 1507 aa  768    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  100 
 
 		 858 aa  1766    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  43.06 
 
 		 880 aa  627  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  41.89 
 
 		 855 aa  614  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  41.13 
 
 		 844 aa  609  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  41.09 
 
 		 901 aa  611  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  40.8 
 
 		 859 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  39.32 
 
 		 918 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  38.58 
 
 		 935 aa  554  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  38.26 
 
 		 941 aa  549  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  37.24 
 
 		 872 aa  547  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  42.52 
 
 		 763 aa  545  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  41.17 
 
 		 851 aa  538  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  41.22 
 
 		 757 aa  535  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  41.25 
 
 		 829 aa  535  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  36.69 
 
 		 904 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  36.96 
 
 		 909 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  39.27 
 
 		 832 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  35.62 
 
 		 899 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  35.15 
 
 		 895 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  34.17 
 
 		 860 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  32.91 
 
 		 860 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  33.06 
 
 		 860 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  32.14 
 
 		 860 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  38.79 
 
 		 774 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  33.37 
 
 		 941 aa  447  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  32.99 
 
 		 951 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  36.88 
 
 		 1061 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  32.46 
 
 		 910 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  33.14 
 
 		 868 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  35.77 
 
 		 776 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  35.76 
 
 		 773 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  34.35 
 
 		 971 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  31.98 
 
 		 873 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  33.03 
 
 		 776 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  30.1 
 
 		 916 aa  341  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  32.02 
 
 		 1084 aa  332  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  32.5 
 
 		 876 aa  331  3e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  28.26 
 
 		 894 aa  321  3.9999999999999996e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  28.55 
 
 		 910 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  28.06 
 
 		 1251 aa  299  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  27.82 
 
 		 1107 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  28.85 
 
 		 926 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  26.55 
 
 		 774 aa  260  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  26.16 
 
 		 916 aa  258  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  28.14 
 
 		 923 aa  245  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  28.36 
 
 		 761 aa  193  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  24.41 
 
 		 882 aa  180  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  24.15 
 
 		 914 aa  161  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  21.34 
 
 		 910 aa  84  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  21.86 
 
 		 955 aa  55.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  28.65 
 
 		 805 aa  54.7  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  23.23 
 
 		 1188 aa  51.6  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  27.46 
 
 		 733 aa  51.6  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  22.5 
 
 		 572 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  28.26 
 
 		 1118 aa  49.7  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.81 
 
 		 1187 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  21.23 
 
 		 801 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>