47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0921 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  50.53 
 
 		 796 aa  735    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 775 aa  1583    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  36.74 
 
 		 793 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  33.64 
 
 		 819 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  33.56 
 
 		 787 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  35.21 
 
 		 801 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  31.99 
 
 		 796 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  31.4 
 
 		 839 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  28.4 
 
 		 836 aa  212  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 		 793 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  28.96 
 
 		 805 aa  168  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  28.18 
 
 		 955 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  23.22 
 
 		 728 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  26.08 
 
 		 949 aa  124  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  23.71 
 
 		 826 aa  121  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  24.72 
 
 		 1187 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  21.46 
 
 		 734 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  22 
 
 		 734 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  23.13 
 
 		 910 aa  78.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  22.71 
 
 		 831 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  23.89 
 
 		 1188 aa  75.5  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  23.8 
 
 		 770 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  24.4 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  21.72 
 
 		 883 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  24.18 
 
 		 1118 aa  68.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  23.6 
 
 		 757 aa  65.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  24.13 
 
 		 936 aa  64.3  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  21.72 
 
 		 733 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  25.82 
 
 		 1107 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  18.4 
 
 		 572 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  23.02 
 
 		 773 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  26.89 
 
 		 829 aa  55.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  19.54 
 
 		 856 aa  54.7  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  23.29 
 
 		 776 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  21.49 
 
 		 897 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  17.92 
 
 		 926 aa  51.2  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  20.75 
 
 		 757 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.25 
 
 		 725 aa  50.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  22.02 
 
 		 755 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  22.79 
 
 		 844 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  25.29 
 
 		 901 aa  48.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.21 
 
 		 720 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  21.69 
 
 		 585 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  23.54 
 
 		 763 aa  46.2  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  21.2 
 
 		 831 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  19.89 
 
 		 661 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  26.94 
 
 		 776 aa  44.3  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>