44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2294 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 831 aa  1727    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  27.35 
 
 		 585 aa  147  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  27.15 
 
 		 572 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  25.58 
 
 		 734 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  26.82 
 
 		 734 aa  127  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  23.68 
 
 		 728 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  27.08 
 
 		 883 aa  95.5  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  23.53 
 
 		 955 aa  93.6  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  24.24 
 
 		 856 aa  88.6  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  23.21 
 
 		 936 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  23.06 
 
 		 801 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  21.18 
 
 		 949 aa  76.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.98 
 
 		 733 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  23.45 
 
 		 897 aa  70.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  22.6 
 
 		 880 aa  70.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  23.48 
 
 		 909 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  20 
 
 		 763 aa  65.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.76 
 
 		 793 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  22.08 
 
 		 757 aa  60.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  20.39 
 
 		 876 aa  59.3  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  21 
 
 		 796 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  22.2 
 
 		 926 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  21.56 
 
 		 1187 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  22.77 
 
 		 787 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  23.22 
 
 		 819 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  20.99 
 
 		 894 aa  52.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  22.01 
 
 		 910 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  22.24 
 
 		 844 aa  52  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  30.92 
 
 		 831 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  19.66 
 
 		 776 aa  52  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  38.46 
 
 		 553 aa  50.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  22.73 
 
 		 826 aa  50.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  21.32 
 
 		 774 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  20.51 
 
 		 773 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  23.31 
 
 		 901 aa  49.3  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 556 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  19.76 
 
 		 931 aa  48.5  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  24.24 
 
 		 770 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  21.97 
 
 		 755 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  20.17 
 
 		 774 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  22.95 
 
 		 935 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  19.73 
 
 		 904 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  21.2 
 
 		 775 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  41.07 
 
 		 568 aa  45.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>