92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1265 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  100 
 
 		 657 aa  1344    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  49.62 
 
 		 674 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  47.51 
 
 		 657 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  47.51 
 
 		 657 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  47.82 
 
 		 681 aa  571  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  47.06 
 
 		 662 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  41.42 
 
 		 712 aa  518  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  42.32 
 
 		 672 aa  465  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  41.53 
 
 		 663 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  37.8 
 
 		 663 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  38.25 
 
 		 659 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  41.09 
 
 		 655 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  39.78 
 
 		 661 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  38.9 
 
 		 661 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  40.8 
 
 		 668 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  41.37 
 
 		 675 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  40.85 
 
 		 678 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  40.54 
 
 		 678 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  38.65 
 
 		 660 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  41.27 
 
 		 692 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  41.12 
 
 		 693 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  36.04 
 
 		 659 aa  396  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  41.19 
 
 		 693 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  36.79 
 
 		 659 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  34.04 
 
 		 672 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  38.28 
 
 		 641 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  36.2 
 
 		 686 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  33.53 
 
 		 672 aa  372  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  37.77 
 
 		 610 aa  363  4e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  37.23 
 
 		 652 aa  352  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  37.31 
 
 		 660 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  35.7 
 
 		 687 aa  345  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.68 
 
 		 662 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  32.25 
 
 		 651 aa  325  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.04 
 
 		 659 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  35.13 
 
 		 720 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.59 
 
 		 656 aa  264  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  28.68 
 
 		 614 aa  263  4.999999999999999e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  29.73 
 
 		 611 aa  256  9e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.09 
 
 		 651 aa  241  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.28 
 
 		 565 aa  225  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  28.15 
 
 		 658 aa  207  5e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.57 
 
 		 1433 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  23.6 
 
 		 1526 aa  87  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  24.06 
 
 		 1537 aa  82  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  22.27 
 
 		 1593 aa  67.4  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.48 
 
 		 720 aa  67.4  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  25 
 
 		 725 aa  67  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.94 
 
 		 741 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.14 
 
 		 741 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.32 
 
 		 723 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.92 
 
 		 764 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.32 
 
 		 708 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.97 
 
 		 717 aa  55.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.13 
 
 		 751 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.38 
 
 		 759 aa  54.3  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.41 
 
 		 720 aa  54.3  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.36 
 
 		 765 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.53 
 
 		 724 aa  53.9  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  21.43 
 
 		 758 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.45 
 
 		 723 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.62 
 
 		 735 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  24.67 
 
 		 675 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.56 
 
 		 721 aa  51.6  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  24.67 
 
 		 770 aa  51.2  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.67 
 
 		 797 aa  51.2  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.67 
 
 		 770 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.67 
 
 		 776 aa  50.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.67 
 
 		 776 aa  50.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  27.95 
 
 		 826 aa  50.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.81 
 
 		 757 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.43 
 
 		 778 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.16 
 
 		 698 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.14 
 
 		 732 aa  48.1  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.65 
 
 		 718 aa  48.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.81 
 
 		 778 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.81 
 
 		 778 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.13 
 
 		 734 aa  47.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  22.52 
 
 		 727 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  25.16 
 
 		 757 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.52 
 
 		 746 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.04 
 
 		 731 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.68 
 
 		 734 aa  46.2  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.51 
 
 		 729 aa  46.2  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  23.41 
 
 		 723 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  23.76 
 
 		 758 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  25.25 
 
 		 839 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.17 
 
 		 781 aa  45.8  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  27.12 
 
 		 895 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  23.57 
 
 		 706 aa  44.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.44 
 
 		 760 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.22 
 
 		 623 aa  44.3  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>