33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2875 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  711    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  75.22 
 
 		 350 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  66.67 
 
 		 380 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0571  hypothetical protein  56.19 
 
 		 364 aa  381  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5716  hypothetical protein  55.49 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1101  hypothetical protein  55.77 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5100  hypothetical protein  55.11 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5479  hypothetical protein  55.11 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5188  hypothetical protein  55.11 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  54.38 
 
 		 363 aa  345  6e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  54 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2797  hypothetical protein  49.46 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2139  hypothetical protein  56.08 
 
 		 383 aa  318  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0012  hypothetical protein  51.2 
 
 		 393 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0010  hypothetical protein  51.16 
 
 		 414 aa  298  8e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  45.8 
 
 		 360 aa  286  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  45.83 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  43.64 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0483  hypothetical protein  42.55 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0771  hypothetical protein  42.99 
 
 		 351 aa  222  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2008  hypothetical protein  39.82 
 
 		 365 aa  202  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0491  hypothetical protein  34.97 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  26.01 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  26.21 
 
 		 661 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  28.98 
 
 		 647 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1705  hypothetical protein  28.9 
 
 		 706 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.410139  hitchhiker  0.00605437 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  24.39 
 
 		 627 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  24.1 
 
 		 602 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  27.16 
 
 		 644 aa  46.2  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  38.54 
 
 		 856 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  27.04 
 
 		 644 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  22.87 
 
 		 604 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  23.95 
 
 		 621 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>