139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0438 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  51.08 
 
 		 673 aa  707    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  100 
 
 		 647 aa  1341    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  32.06 
 
 		 644 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  29.41 
 
 		 627 aa  261  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  28.55 
 
 		 642 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  31.12 
 
 		 604 aa  254  3e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  28.12 
 
 		 644 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  29.19 
 
 		 621 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  29.5 
 
 		 621 aa  244  5e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  30.86 
 
 		 621 aa  243  9e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  29.3 
 
 		 621 aa  242  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  28.74 
 
 		 668 aa  219  8.999999999999998e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  27.49 
 
 		 647 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  27.62 
 
 		 622 aa  193  9e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.15 
 
 		 569 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  27.49 
 
 		 650 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  26.28 
 
 		 663 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  25.41 
 
 		 670 aa  184  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  26.57 
 
 		 615 aa  180  9e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  26.32 
 
 		 611 aa  180  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  27.53 
 
 		 649 aa  176  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  25.78 
 
 		 645 aa  170  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  27.3 
 
 		 615 aa  160  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.3 
 
 		 1505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  27.14 
 
 		 610 aa  105  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0545  glucan 14-alpha-glucosidase  27.78 
 
 		 734 aa  97.1  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  25.89 
 
 		 602 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  26.62 
 
 		 611 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2647  Glucoamylase and related glycosyl hydrolase- like protein  26.38 
 
 		 683 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  25.44 
 
 		 363 aa  79.7  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1149  glucan 14-alpha-glucosidase  24.7 
 
 		 715 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  32.99 
 
 		 1592 aa  75.1  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  25.06 
 
 		 623 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  25.26 
 
 		 625 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  25.19 
 
 		 599 aa  68.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  23.84 
 
 		 625 aa  68.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.53 
 
 		 801 aa  67.8  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  23.95 
 
 		 870 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  24.37 
 
 		 595 aa  65.1  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.23 
 
 		 715 aa  64.3  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.21 
 
 		 803 aa  64.3  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.21 
 
 		 802 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  24.01 
 
 		 621 aa  62  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  25.37 
 
 		 786 aa  61.6  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.86 
 
 		 761 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  24.47 
 
 		 622 aa  60.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  24.01 
 
 		 602 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  22.69 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  24.88 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  23.25 
 
 		 592 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  22.75 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  23.69 
 
 		 627 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.07 
 
 		 692 aa  58.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.07 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  23.13 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  23.76 
 
 		 602 aa  57.4  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  23 
 
 		 632 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  24.01 
 
 		 600 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  25.58 
 
 		 407 aa  56.2  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4631  glycoside hydrolase 15-related  22.89 
 
 		 386 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  22.75 
 
 		 592 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  23.8 
 
 		 602 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  22.6 
 
 		 589 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  23.19 
 
 		 627 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4222  glycoside hydrolase 15-related protein  25.27 
 
 		 484 aa  54.7  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  24.4 
 
 		 487 aa  53.5  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  21.7 
 
 		 605 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  20.56 
 
 		 617 aa  52.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.74 
 
 		 800 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.93 
 
 		 786 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  25.93 
 
 		 786 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  23.24 
 
 		 598 aa  51.6  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.72 
 
 		 814 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  23.76 
 
 		 893 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31600  glycosyl hydrolase, glucoamylase  29.27 
 
 		 549 aa  51.2  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  23.72 
 
 		 867 aa  51.2  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  21.47 
 
 		 821 aa  50.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  21.2 
 
 		 635 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.71 
 
 		 803 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  22.91 
 
 		 596 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 602 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  23.41 
 
 		 617 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  21.93 
 
 		 594 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  23.56 
 
 		 597 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  21.2 
 
 		 662 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  22.3 
 
 		 609 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  23.29 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  20.99 
 
 		 605 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  23.82 
 
 		 627 aa  48.9  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  28.98 
 
 		 353 aa  48.9  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  19.87 
 
 		 598 aa  48.9  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22 
 
 		 860 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  22.14 
 
 		 609 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  22.52 
 
 		 610 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  27.85 
 
 		 380 aa  47.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  24.53 
 
 		 606 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  23.37 
 
 		 876 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  33.33 
 
 		 603 aa  47.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  22.65 
 
 		 599 aa  47.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  21.7 
 
 		 593 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>