109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4631 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4631  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 386 aa  759    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  26.3 
 
 		 644 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  25 
 
 		 621 aa  90.1  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  24.81 
 
 		 621 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  25.57 
 
 		 644 aa  87.8  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  25.68 
 
 		 621 aa  86.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  21.83 
 
 		 622 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  23.33 
 
 		 627 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  30.87 
 
 		 599 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  23.74 
 
 		 621 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  23.96 
 
 		 615 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  24.8 
 
 		 604 aa  76.3  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  31.06 
 
 		 642 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  29.01 
 
 		 611 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  27.24 
 
 		 619 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  27.91 
 
 		 600 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  27.62 
 
 		 649 aa  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  28 
 
 		 602 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  28 
 
 		 602 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  27.24 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.64 
 
 		 569 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  27.5 
 
 		 850 aa  62  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  22.31 
 
 		 647 aa  60.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  25 
 
 		 668 aa  60.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  22.89 
 
 		 673 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  27.1 
 
 		 609 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  28.09 
 
 		 604 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  27.01 
 
 		 609 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  26.75 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  26.85 
 
 		 601 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  27.01 
 
 		 611 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1092  glycoside hydrolase 15-related  29.51 
 
 		 598 aa  56.2  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.281336 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  23.19 
 
 		 598 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  27.55 
 
 		 617 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 		 605 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  26.95 
 
 		 609 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  26.95 
 
 		 609 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  27.36 
 
 		 596 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  26.95 
 
 		 609 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  27.21 
 
 		 610 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 		 610 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  27.21 
 
 		 610 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  27.21 
 
 		 610 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  27.21 
 
 		 610 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  27.21 
 
 		 610 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  27.21 
 
 		 610 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  26.48 
 
 		 609 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  28.97 
 
 		 620 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  27.17 
 
 		 607 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  28.86 
 
 		 601 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  26.04 
 
 		 623 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  25.6 
 
 		 598 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  27.6 
 
 		 626 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  27.92 
 
 		 596 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  26.25 
 
 		 603 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  26.86 
 
 		 613 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  25 
 
 		 608 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0980  glycoside hydrolase 15-related  30.36 
 
 		 598 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  28.24 
 
 		 592 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  28.17 
 
 		 639 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  28.24 
 
 		 592 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  25.84 
 
 		 663 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 608 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  26.89 
 
 		 665 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  25.72 
 
 		 597 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  25.69 
 
 		 623 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  22.22 
 
 		 647 aa  49.7  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  25.08 
 
 		 605 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0989  glycoside hydrolase 15-related  24.52 
 
 		 583 aa  49.7  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.422576  normal  0.0726488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  24.91 
 
 		 600 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  27.21 
 
 		 614 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  26.18 
 
 		 608 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  21.04 
 
 		 584 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  26.09 
 
 		 626 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  26.81 
 
 		 589 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  25 
 
 		 629 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  26.42 
 
 		 727 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  24.29 
 
 		 624 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  26.88 
 
 		 609 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4516  glycoside hydrolase 15-related  27.45 
 
 		 669 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229042 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  26.14 
 
 		 786 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  22.58 
 
 		 670 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  27.53 
 
 		 645 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  25.08 
 
 		 645 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  26.77 
 
 		 610 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  25.24 
 
 		 601 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  21.47 
 
 		 615 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  25.16 
 
 		 586 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  23.68 
 
 		 617 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  26.27 
 
 		 612 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  24.36 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1144  glycoside hydrolase 15-related protein  23.62 
 
 		 696 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  26.42 
 
 		 613 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  25.9 
 
 		 659 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  24.61 
 
 		 602 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  25.38 
 
 		 628 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  24.62 
 
 		 627 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  25.62 
 
 		 627 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  25.33 
 
 		 636 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>