84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0228 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
611 aa  1256    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  32.52 
 
 
644 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  32.92 
 
 
644 aa  337  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  29.61 
 
 
642 aa  296  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  28.55 
 
 
604 aa  233  6e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  25.74 
 
 
673 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  25.92 
 
 
621 aa  187  7e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  25.81 
 
 
621 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  26.95 
 
 
650 aa  183  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  25.27 
 
 
621 aa  183  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  24.85 
 
 
621 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  26.17 
 
 
647 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  25.11 
 
 
647 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  24.96 
 
 
670 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  26.71 
 
 
615 aa  172  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0134624 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  28.48 
 
 
622 aa  170  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.64 
 
 
569 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  29.08 
 
 
627 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  28.46 
 
 
668 aa  163  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  23.68 
 
 
663 aa  163  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  25.7 
 
 
615 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  27.33 
 
 
649 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  26.12 
 
 
645 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  29.35 
 
 
363 aa  122  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  26.49 
 
 
622 aa  89  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.75 
 
 
1505 aa  74.7  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  25.14 
 
 
472 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  24.94 
 
 
1592 aa  72.8  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  23.3 
 
 
602 aa  72.4  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  21.36 
 
 
801 aa  72  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.44 
 
 
803 aa  71.2  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  21.67 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  22.08 
 
 
610 aa  69.3  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.59 
 
 
761 aa  67  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4631  glycoside hydrolase 15-related  29.01 
 
 
386 aa  65.1  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  24.15 
 
 
584 aa  64.7  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.06 
 
 
802 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  21.6 
 
 
800 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0545  glucan 14-alpha-glucosidase  22.2 
 
 
734 aa  60.1  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495812  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  23.04 
 
 
842 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  21.63 
 
 
835 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1149  glucan 14-alpha-glucosidase  28.65 
 
 
715 aa  58.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2647  Glucoamylase and related glycosyl hydrolase- like protein  28.22 
 
 
683 aa  57.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  23.98 
 
 
592 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  22.2 
 
 
844 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  23.2 
 
 
679 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  21.93 
 
 
636 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.36 
 
 
798 aa  54.7  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  22.55 
 
 
589 aa  54.3  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  22.1 
 
 
867 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  22.27 
 
 
677 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  22.27 
 
 
677 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  33.66 
 
 
786 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  24.89 
 
 
595 aa  51.6  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  36.27 
 
 
847 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  22.81 
 
 
621 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  22.05 
 
 
677 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  20.39 
 
 
681 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  20.39 
 
 
692 aa  50.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  23.65 
 
 
592 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  22.14 
 
 
597 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  24.49 
 
 
617 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0219  glycoside hydrolase 15-related  23.4 
 
 
402 aa  48.9  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0997463  hitchhiker  0.0053447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  32.98 
 
 
593 aa  48.5  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  23.15 
 
 
867 aa  48.5  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  22.05 
 
 
672 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  23.37 
 
 
596 aa  47.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1322  glycoside hydrolase 15-related  33.87 
 
 
565 aa  47.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.033472  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  22.27 
 
 
668 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  22.57 
 
 
786 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  23.35 
 
 
610 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.57 
 
 
786 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2413  glycoside hydrolase 15-related  22.64 
 
 
412 aa  47  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  30.85 
 
 
592 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  23.94 
 
 
599 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  27.46 
 
 
487 aa  46.2  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  31 
 
 
627 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  30.28 
 
 
613 aa  45.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0554  glycoside hydrolase 15-related protein  30.65 
 
 
578 aa  45.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000579959  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  31 
 
 
627 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31600  glycosyl hydrolase, glucoamylase  22.82 
 
 
549 aa  44.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  22.16 
 
 
629 aa  44.3  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  29.36 
 
 
635 aa  43.9  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  23.31 
 
 
597 aa  43.9  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>