216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4692 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  97.77 
 
 		 627 aa  1233    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  84.88 
 
 		 635 aa  1076    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 627 aa  1266    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  60.36 
 
 		 621 aa  698    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  38.74 
 
 		 617 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  40.39 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  38.37 
 
 		 619 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  39.07 
 
 		 613 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  38.56 
 
 		 612 aa  379  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  39.41 
 
 		 609 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  39.94 
 
 		 617 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  39.25 
 
 		 609 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  39.77 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  39.25 
 
 		 609 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  39.77 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  38.66 
 
 		 608 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  38.74 
 
 		 594 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  38.59 
 
 		 613 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  39.09 
 
 		 609 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  36.23 
 
 		 606 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  39.61 
 
 		 596 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  38.34 
 
 		 608 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  38.45 
 
 		 595 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  38.76 
 
 		 609 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  39.23 
 
 		 623 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  37.5 
 
 		 868 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  39.27 
 
 		 619 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  39.9 
 
 		 598 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  39.41 
 
 		 626 aa  363  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  37.86 
 
 		 617 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  38.79 
 
 		 621 aa  362  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  38.27 
 
 		 609 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  38.11 
 
 		 611 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  38.45 
 
 		 602 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  39.7 
 
 		 597 aa  360  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  39.08 
 
 		 603 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  37.86 
 
 		 617 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  38.13 
 
 		 605 aa  360  6e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  38.57 
 
 		 610 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  36.69 
 
 		 612 aa  359  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  38.57 
 
 		 610 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  38.57 
 
 		 610 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  38.57 
 
 		 610 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  38.57 
 
 		 610 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  38.57 
 
 		 610 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  38.57 
 
 		 610 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  38.11 
 
 		 625 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  37.91 
 
 		 598 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  39.3 
 
 		 605 aa  357  5e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  37.97 
 
 		 623 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  37.38 
 
 		 600 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  39 
 
 		 599 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  40.06 
 
 		 600 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  39.25 
 
 		 626 aa  355  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  38.74 
 
 		 602 aa  354  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  39.24 
 
 		 596 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  38.82 
 
 		 596 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  37.27 
 
 		 605 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  37.5 
 
 		 623 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  37.58 
 
 		 598 aa  350  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  37.93 
 
 		 665 aa  351  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  36.87 
 
 		 625 aa  350  6e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  38 
 
 		 611 aa  349  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  39.8 
 
 		 602 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  36.84 
 
 		 626 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  36.95 
 
 		 869 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  36.78 
 
 		 598 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  36.2 
 
 		 612 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  36.79 
 
 		 629 aa  343  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  37.46 
 
 		 592 aa  342  9e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  37.68 
 
 		 592 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  38.06 
 
 		 611 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  36.9 
 
 		 599 aa  339  7e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  35.31 
 
 		 679 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  37.4 
 
 		 600 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  37.28 
 
 		 629 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  36.68 
 
 		 601 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  35.99 
 
 		 609 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  34.94 
 
 		 894 aa  337  5e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  37.52 
 
 		 601 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  36.97 
 
 		 627 aa  336  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  38.22 
 
 		 602 aa  335  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  36.22 
 
 		 628 aa  334  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  37.29 
 
 		 601 aa  333  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  37.03 
 
 		 613 aa  333  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  35.85 
 
 		 636 aa  333  8e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  35.96 
 
 		 608 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  37.48 
 
 		 602 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  36.95 
 
 		 601 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  37.48 
 
 		 602 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  36.65 
 
 		 677 aa  329  8e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  36.65 
 
 		 677 aa  329  8e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  36.17 
 
 		 593 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  36.48 
 
 		 610 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  36.49 
 
 		 677 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  37.02 
 
 		 624 aa  327  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  36.79 
 
 		 645 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  35.47 
 
 		 594 aa  326  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  36.53 
 
 		 603 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  36.56 
 
 		 596 aa  324  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>