213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2298 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  95.39 
 
 		 608 aa  1204    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 608 aa  1258    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  55.83 
 
 		 619 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  69.79 
 
 		 609 aa  885    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  57.6 
 
 		 617 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  51.97 
 
 		 603 aa  609  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  50.66 
 
 		 623 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  48.55 
 
 		 625 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  45.09 
 
 		 606 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  48.94 
 
 		 612 aa  553  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  48.05 
 
 		 613 aa  547  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  48.26 
 
 		 599 aa  537  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  48.41 
 
 		 613 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  48.24 
 
 		 594 aa  531  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  47.69 
 
 		 610 aa  527  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  46.93 
 
 		 594 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  43.99 
 
 		 612 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05440  glycosyl hydrolase, putative  40.09 
 
 		 656 aa  450  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  42.11 
 
 		 595 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  42.71 
 
 		 601 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  41.46 
 
 		 605 aa  435  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  41.4 
 
 		 625 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  41.33 
 
 		 600 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  40.55 
 
 		 623 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  40.8 
 
 		 596 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  41.07 
 
 		 627 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  41.04 
 
 		 619 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  42.03 
 
 		 609 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  40.1 
 
 		 623 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  41.58 
 
 		 586 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  41.2 
 
 		 597 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  40.48 
 
 		 679 aa  418  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  40.33 
 
 		 613 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  39.87 
 
 		 602 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  41.5 
 
 		 602 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  39.2 
 
 		 619 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  41.53 
 
 		 609 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  39.8 
 
 		 620 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  41.69 
 
 		 609 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  41.33 
 
 		 602 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  41.69 
 
 		 609 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  39.46 
 
 		 608 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  39.2 
 
 		 619 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  41.36 
 
 		 609 aa  415  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  40.89 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  40.61 
 
 		 598 aa  411  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  40.89 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  41.36 
 
 		 609 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  40.89 
 
 		 626 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  41.02 
 
 		 611 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  40.03 
 
 		 602 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  40.89 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  40.89 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  40.89 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  40.89 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  40.89 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  38.55 
 
 		 617 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  40.76 
 
 		 626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  39.4 
 
 		 629 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  39.37 
 
 		 627 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  40.72 
 
 		 665 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  40.31 
 
 		 600 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  40.51 
 
 		 602 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  39.49 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  41.28 
 
 		 624 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  39.57 
 
 		 601 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  39.5 
 
 		 598 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  39.47 
 
 		 601 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  40.07 
 
 		 602 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  39.58 
 
 		 636 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  38.19 
 
 		 628 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  40.64 
 
 		 596 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  40.07 
 
 		 616 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  39.49 
 
 		 600 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  38.92 
 
 		 601 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  39.69 
 
 		 596 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  39.56 
 
 		 894 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  39.29 
 
 		 611 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  38.13 
 
 		 629 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  38.18 
 
 		 593 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0987  glycoside hydrolase 15-related  39.39 
 
 		 886 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  38.44 
 
 		 614 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  38.75 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  39.36 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  39.97 
 
 		 621 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  40.66 
 
 		 645 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  38.61 
 
 		 592 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  39.04 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  41.15 
 
 		 629 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  38.73 
 
 		 636 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  38.46 
 
 		 592 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  40.07 
 
 		 617 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  36.66 
 
 		 612 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  36.52 
 
 		 868 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  38.25 
 
 		 677 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  38.25 
 
 		 677 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  38.25 
 
 		 677 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  40.63 
 
 		 659 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  39.6 
 
 		 617 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  38.54 
 
 		 603 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>