215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2133 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  53.9 
 
 
623 aa  652    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  54.08 
 
 
619 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  56.03 
 
 
610 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  57.75 
 
 
596 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  61.73 
 
 
598 aa  745    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  62.05 
 
 
586 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  57.17 
 
 
602 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  55.52 
 
 
617 aa  659    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  56.03 
 
 
610 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  55.35 
 
 
609 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  55.52 
 
 
665 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  55.81 
 
 
600 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  58.25 
 
 
628 aa  700    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  55.35 
 
 
609 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  100 
 
 
602 aa  1219    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  53.41 
 
 
601 aa  651    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  59.03 
 
 
611 aa  696    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  53.74 
 
 
600 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  54 
 
 
602 aa  663    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  57.99 
 
 
629 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  53.73 
 
 
623 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  55.35 
 
 
609 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  63.56 
 
 
602 aa  746    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  55.69 
 
 
609 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  55.69 
 
 
611 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  63.22 
 
 
597 aa  756    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  62.35 
 
 
601 aa  751    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  55.52 
 
 
609 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  60.51 
 
 
627 aa  731    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  60.82 
 
 
598 aa  718    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  69.17 
 
 
602 aa  823    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  67.55 
 
 
605 aa  822    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  56.03 
 
 
610 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  57.69 
 
 
601 aa  685    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  56.03 
 
 
610 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  56.03 
 
 
610 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  56.03 
 
 
610 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  56.03 
 
 
610 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  55.52 
 
 
609 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  53.74 
 
 
603 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  61.98 
 
 
600 aa  732    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  57.17 
 
 
602 aa  652    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  56.54 
 
 
596 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  52.38 
 
 
619 aa  633  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  52.38 
 
 
619 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  52.55 
 
 
620 aa  630  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  53.22 
 
 
601 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  52.8 
 
 
597 aa  629  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  54.16 
 
 
626 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  53.99 
 
 
626 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  51.95 
 
 
629 aa  623  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  52.61 
 
 
627 aa  622  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  53.2 
 
 
593 aa  624  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  53.98 
 
 
608 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  53.47 
 
 
613 aa  618  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  52.57 
 
 
610 aa  621  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  53.31 
 
 
605 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  53.67 
 
 
614 aa  617  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  53.14 
 
 
594 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  53.22 
 
 
605 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  52.05 
 
 
629 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  52.47 
 
 
598 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  52.75 
 
 
616 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  51.62 
 
 
626 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  51.62 
 
 
598 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  51.69 
 
 
589 aa  566  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  53.26 
 
 
727 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  49.66 
 
 
596 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  49.23 
 
 
850 aa  557  1e-157  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  48.82 
 
 
599 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  48.15 
 
 
593 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  50.17 
 
 
604 aa  532  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  49.41 
 
 
643 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  47.1 
 
 
592 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  46.59 
 
 
592 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  46.73 
 
 
605 aa  501  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  48.83 
 
 
629 aa  501  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  47 
 
 
596 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  43.62 
 
 
632 aa  487  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  44.37 
 
 
636 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  43.78 
 
 
639 aa  475  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17860  glycosyl hydrolase, glucoamylase  41.56 
 
 
627 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  41.57 
 
 
595 aa  428  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  39.67 
 
 
612 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  40.1 
 
 
608 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  40.2 
 
 
625 aa  422  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  39.87 
 
 
608 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  38.39 
 
 
612 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  39.13 
 
 
609 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  42.19 
 
 
610 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  38.36 
 
 
612 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  42.03 
 
 
599 aa  405  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  38.71 
 
 
613 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  40.99 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  39.44 
 
 
596 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  37.5 
 
 
619 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  37.25 
 
 
894 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  38.72 
 
 
594 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  40.14 
 
 
611 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  39.12 
 
 
599 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>