223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2242 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  56.06 
 
 		 619 aa  657    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  57.14 
 
 		 620 aa  663    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  58.28 
 
 		 608 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  60.32 
 
 		 619 aa  739    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  55.33 
 
 		 605 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  85.23 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  58.38 
 
 		 596 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  54.8 
 
 		 605 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  57.58 
 
 		 602 aa  660    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  57.67 
 
 		 598 aa  687    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  59.16 
 
 		 623 aa  750    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  59.54 
 
 		 616 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  57.75 
 
 		 602 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  59.73 
 
 		 617 aa  711    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  53.85 
 
 		 629 aa  664    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  55.83 
 
 		 614 aa  674    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  85.23 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  96.39 
 
 		 609 aa  1210    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  54.3 
 
 		 627 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  57.94 
 
 		 613 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  84.7 
 
 		 665 aa  1070    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  57.58 
 
 		 600 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  58.36 
 
 		 598 aa  663    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  57.47 
 
 		 628 aa  688    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  57.83 
 
 		 602 aa  677    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  55.98 
 
 		 601 aa  691    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  56.88 
 
 		 610 aa  683    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  58.06 
 
 		 611 aa  696    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  57.96 
 
 		 600 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  76.37 
 
 		 626 aa  976    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  57.24 
 
 		 601 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  59.43 
 
 		 593 aa  720    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  56.71 
 
 		 601 aa  673    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  54.51 
 
 		 597 aa  669    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  76.65 
 
 		 727 aa  875    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  59.16 
 
 		 623 aa  745    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  96.06 
 
 		 609 aa  1204    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  56.92 
 
 		 601 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 609 aa  1244    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  76.81 
 
 		 626 aa  987    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  98.82 
 
 		 611 aa  1206    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  60 
 
 		 597 aa  704    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  96.22 
 
 		 609 aa  1206    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  56.23 
 
 		 619 aa  657    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  55.93 
 
 		 596 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  96.55 
 
 		 609 aa  1186    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  56.5 
 
 		 602 aa  704    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  85.23 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  85.23 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  57.39 
 
 		 600 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  85.23 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  85.23 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  85.23 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  57.31 
 
 		 629 aa  685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  58.02 
 
 		 586 aa  697    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  55.69 
 
 		 602 aa  642    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  55.78 
 
 		 629 aa  651    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  56.97 
 
 		 594 aa  673    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  56.86 
 
 		 603 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  96.22 
 
 		 609 aa  1206    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  55.31 
 
 		 627 aa  633  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  55.07 
 
 		 605 aa  631  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  53.56 
 
 		 598 aa  621  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  52.59 
 
 		 626 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  54.33 
 
 		 602 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  52.36 
 
 		 599 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  52.59 
 
 		 598 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  51.86 
 
 		 596 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  50 
 
 		 850 aa  571  1e-161  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  50.17 
 
 		 589 aa  570  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  48.74 
 
 		 605 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  48.63 
 
 		 596 aa  535  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  47.95 
 
 		 592 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  47.77 
 
 		 592 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  49.07 
 
 		 593 aa  531  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  49.08 
 
 		 629 aa  528  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  47.37 
 
 		 643 aa  522  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  47.27 
 
 		 604 aa  522  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  44.37 
 
 		 636 aa  499  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  43.97 
 
 		 632 aa  498  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  43.38 
 
 		 639 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  42.81 
 
 		 595 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  39.4 
 
 		 612 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17860  glycosyl hydrolase, glucoamylase  40.82 
 
 		 627 aa  425  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  41.79 
 
 		 610 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  38 
 
 		 612 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  41.01 
 
 		 625 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  40.49 
 
 		 596 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  41.48 
 
 		 599 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  40.1 
 
 		 613 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  41.36 
 
 		 608 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  40.16 
 
 		 599 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  40.23 
 
 		 612 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  40.24 
 
 		 609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  40.8 
 
 		 608 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  39.23 
 
 		 613 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  39.49 
 
 		 594 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  39.83 
 
 		 594 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  39.43 
 
 		 607 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  39.25 
 
 		 679 aa  389  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>