218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3676 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  76.67 
 
 		 602 aa  962    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  55.99 
 
 		 596 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  58.06 
 
 		 619 aa  704    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  58.6 
 
 		 610 aa  699    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  54.93 
 
 		 598 aa  656    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  55.61 
 
 		 616 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  55.22 
 
 		 596 aa  658    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  57.39 
 
 		 617 aa  700    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  71.5 
 
 		 629 aa  906    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  58.6 
 
 		 610 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  58.1 
 
 		 609 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  53.42 
 
 		 627 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  55.41 
 
 		 619 aa  664    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  58.26 
 
 		 665 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  54.78 
 
 		 600 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  54.68 
 
 		 586 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  52.66 
 
 		 628 aa  653    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  58.57 
 
 		 609 aa  698    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  55.16 
 
 		 601 aa  666    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  54.99 
 
 		 605 aa  643    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  74.54 
 
 		 601 aa  944    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  55.2 
 
 		 613 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  58.46 
 
 		 611 aa  694    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 600 aa  1229    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  57.19 
 
 		 626 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  53.7 
 
 		 629 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  77.54 
 
 		 601 aa  974    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  58.01 
 
 		 593 aa  705    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  55.63 
 
 		 602 aa  664    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  71.33 
 
 		 597 aa  912    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  56.33 
 
 		 620 aa  662    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  57.94 
 
 		 609 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  53.74 
 
 		 602 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  54.86 
 
 		 598 aa  635    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  55.57 
 
 		 619 aa  664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  53.73 
 
 		 614 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  55.85 
 
 		 623 aa  690    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  57.96 
 
 		 609 aa  704    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  58.77 
 
 		 611 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  55.97 
 
 		 597 aa  660    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  58.1 
 
 		 609 aa  709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  56.36 
 
 		 602 aa  649    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  58.04 
 
 		 626 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  55.29 
 
 		 602 aa  661    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  58.6 
 
 		 610 aa  699    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  54.72 
 
 		 601 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  58.6 
 
 		 610 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  58.6 
 
 		 610 aa  699    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  58.6 
 
 		 610 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  58.6 
 
 		 610 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  55.68 
 
 		 623 aa  692    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  53.07 
 
 		 608 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  53.46 
 
 		 594 aa  641    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  73.92 
 
 		 603 aa  919    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  58.1 
 
 		 609 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  53.81 
 
 		 610 aa  644    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  53 
 
 		 629 aa  632  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  53.39 
 
 		 627 aa  632  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  54.45 
 
 		 605 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  53.18 
 
 		 600 aa  622  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  53.95 
 
 		 605 aa  621  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  53.41 
 
 		 602 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  51.27 
 
 		 598 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  50.84 
 
 		 626 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  54.98 
 
 		 727 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  50.84 
 
 		 598 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  52.12 
 
 		 596 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  50 
 
 		 589 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  49.07 
 
 		 599 aa  556  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  47.26 
 
 		 592 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  46.92 
 
 		 592 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  45.39 
 
 		 643 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  45.33 
 
 		 593 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  43.86 
 
 		 850 aa  508  1e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  46.25 
 
 		 596 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  43.95 
 
 		 605 aa  501  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  45.89 
 
 		 604 aa  494  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  46.15 
 
 		 629 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  41.75 
 
 		 632 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  41.87 
 
 		 636 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  40.66 
 
 		 625 aa  431  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  38.41 
 
 		 612 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  39.91 
 
 		 639 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  40.7 
 
 		 610 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  40.2 
 
 		 612 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  37.01 
 
 		 612 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0980  glycoside hydrolase 15-related  40.57 
 
 		 598 aa  398  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  40.37 
 
 		 619 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  39.49 
 
 		 608 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  39.16 
 
 		 608 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  41.22 
 
 		 595 aa  392  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  38.97 
 
 		 613 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17860  glycosyl hydrolase, glucoamylase  38.19 
 
 		 627 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  39.12 
 
 		 894 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  38.75 
 
 		 617 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  39.4 
 
 		 617 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  39.23 
 
 		 617 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  38.74 
 
 		 596 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  38.92 
 
 		 611 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  38.78 
 
 		 599 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>