214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1617 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  56.72 
 
 
613 aa  657    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  63.67 
 
 
610 aa  806    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  100 
 
 
612 aa  1270    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  54.98 
 
 
599 aa  646    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  68.52 
 
 
613 aa  867    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  52.8 
 
 
594 aa  611  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  52.14 
 
 
594 aa  608  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  48.96 
 
 
623 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05440  glycosyl hydrolase, putative  46.26 
 
 
656 aa  572  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  48.06 
 
 
612 aa  568  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  46.18 
 
 
606 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  47.9 
 
 
625 aa  561  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  48.94 
 
 
608 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  48.77 
 
 
608 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  48.2 
 
 
619 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  47.05 
 
 
617 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  48.2 
 
 
603 aa  544  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  47.54 
 
 
609 aa  535  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  44.24 
 
 
595 aa  481  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  42.95 
 
 
625 aa  464  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  42.44 
 
 
624 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  41.89 
 
 
598 aa  451  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  41.48 
 
 
645 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  41.97 
 
 
586 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  41.65 
 
 
601 aa  440  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  40.07 
 
 
602 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  40.81 
 
 
894 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  42.01 
 
 
616 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  39.64 
 
 
627 aa  433  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  40.39 
 
 
600 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  40.07 
 
 
609 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  40.07 
 
 
610 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  39.07 
 
 
617 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  40.07 
 
 
610 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  39.57 
 
 
609 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  40.07 
 
 
665 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  39.9 
 
 
609 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  41.18 
 
 
679 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  40.96 
 
 
602 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  40.07 
 
 
610 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  40.07 
 
 
610 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  40.07 
 
 
610 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  40.07 
 
 
610 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  40.07 
 
 
610 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  39.9 
 
 
609 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  39.53 
 
 
601 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  39.4 
 
 
609 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  40.49 
 
 
626 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  39.87 
 
 
602 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  39.74 
 
 
609 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  39.57 
 
 
611 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  40.22 
 
 
636 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  40.5 
 
 
601 aa  425  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  40.19 
 
 
605 aa  423  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  39.87 
 
 
602 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  40 
 
 
626 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  40.75 
 
 
868 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  40.36 
 
 
597 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  40.86 
 
 
598 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  41.16 
 
 
611 aa  422  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  40.56 
 
 
611 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  39.74 
 
 
601 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9017  glycoside hydrolase  41.64 
 
 
639 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  38.36 
 
 
602 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  39.74 
 
 
619 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  40.49 
 
 
619 aa  412  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  40.49 
 
 
619 aa  412  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  39.43 
 
 
668 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  39.27 
 
 
672 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  39.14 
 
 
594 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  40.2 
 
 
600 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  39.84 
 
 
620 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  39.44 
 
 
593 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  38.63 
 
 
642 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  40.26 
 
 
636 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  38.47 
 
 
608 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  40.03 
 
 
602 aa  405  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  38.61 
 
 
629 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  40.23 
 
 
645 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  39.07 
 
 
599 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  39.27 
 
 
677 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  39.48 
 
 
613 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  39.27 
 
 
677 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  39.27 
 
 
677 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  38.88 
 
 
596 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  40.94 
 
 
621 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  39.66 
 
 
662 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  38.59 
 
 
623 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  38.87 
 
 
596 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  39.14 
 
 
627 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0987  glycoside hydrolase 15-related  39.84 
 
 
886 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  39.17 
 
 
596 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  39.56 
 
 
635 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  37.62 
 
 
597 aa  398  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1640  glycoside hydrolase 15-related  39.19 
 
 
887 aa  399  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  40.39 
 
 
617 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  40.13 
 
 
617 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  38.71 
 
 
599 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  38.17 
 
 
600 aa  398  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  40.91 
 
 
607 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>