224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5504 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  82.2 
 
 
592 aa  986    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  82.03 
 
 
592 aa  985    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
596 aa  1191    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  49.09 
 
 
623 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  49.06 
 
 
626 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  49.49 
 
 
626 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  49.75 
 
 
619 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  49.09 
 
 
623 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  48.8 
 
 
609 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  48.38 
 
 
665 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  48.64 
 
 
610 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  47.59 
 
 
602 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  48.38 
 
 
610 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  48.38 
 
 
610 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  48.52 
 
 
593 aa  535  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  48.63 
 
 
609 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  48.12 
 
 
611 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  48.46 
 
 
609 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  48.38 
 
 
610 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  48.38 
 
 
610 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  48.46 
 
 
609 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  48.38 
 
 
610 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  48.38 
 
 
610 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  48.38 
 
 
610 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  49.57 
 
 
600 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  49.83 
 
 
602 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  48.29 
 
 
609 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  49.83 
 
 
602 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  49.14 
 
 
598 aa  529  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  48.97 
 
 
596 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  47.77 
 
 
609 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  47.68 
 
 
600 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  47.43 
 
 
601 aa  522  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  48.98 
 
 
614 aa  523  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  48.63 
 
 
611 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  47.53 
 
 
598 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  47.19 
 
 
594 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  46.3 
 
 
617 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  46.25 
 
 
600 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  46.66 
 
 
586 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  47.34 
 
 
602 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  48.15 
 
 
616 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  47.87 
 
 
605 aa  505  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  45.53 
 
 
601 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  47.04 
 
 
597 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  44.07 
 
 
627 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  47 
 
 
602 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  46.15 
 
 
627 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  47.6 
 
 
596 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  45.09 
 
 
601 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  44.06 
 
 
597 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  44.9 
 
 
605 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  43.89 
 
 
629 aa  489  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  46.68 
 
 
620 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  47.19 
 
 
608 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  46.56 
 
 
603 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  48.21 
 
 
613 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  46.6 
 
 
619 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  46.43 
 
 
619 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  44.69 
 
 
605 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  46.09 
 
 
596 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  45.8 
 
 
601 aa  476  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  45.35 
 
 
629 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  46.26 
 
 
599 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  45.09 
 
 
628 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  45.18 
 
 
589 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  45.33 
 
 
602 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  45.07 
 
 
629 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  43.27 
 
 
598 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  43.32 
 
 
850 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  44.39 
 
 
593 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  42.33 
 
 
626 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  44.52 
 
 
643 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  44.34 
 
 
727 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  42.33 
 
 
598 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  41.23 
 
 
604 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  39.03 
 
 
632 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  40.64 
 
 
605 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  39.26 
 
 
612 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  43.37 
 
 
629 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  38.61 
 
 
636 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  39.5 
 
 
639 aa  396  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  39.69 
 
 
608 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  39.52 
 
 
608 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  39.19 
 
 
625 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  38.26 
 
 
619 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  38.8 
 
 
617 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  39.56 
 
 
607 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  40.44 
 
 
617 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  39.46 
 
 
611 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  40.3 
 
 
617 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  37.06 
 
 
612 aa  363  4e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  36.59 
 
 
609 aa  362  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17860  glycosyl hydrolase, glucoamylase  38.6 
 
 
627 aa  360  5e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  37.35 
 
 
596 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  37.86 
 
 
599 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  37.26 
 
 
595 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  39.57 
 
 
627 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  39.24 
 
 
627 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  35.26 
 
 
612 aa  353  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>