215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1950 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  64.16 
 
 
643 aa  737    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  100 
 
 
629 aa  1241    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  57.98 
 
 
589 aa  627  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  54.82 
 
 
604 aa  595  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  52.73 
 
 
605 aa  581  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  52.21 
 
 
597 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  51.02 
 
 
586 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  53.52 
 
 
600 aa  558  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  50.58 
 
 
609 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  50.58 
 
 
609 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  50.33 
 
 
609 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  50.42 
 
 
609 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  51.14 
 
 
629 aa  551  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  50.74 
 
 
628 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  51.44 
 
 
602 aa  548  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  49.08 
 
 
609 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  49.49 
 
 
611 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  50.33 
 
 
627 aa  544  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  50.59 
 
 
601 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  49.75 
 
 
609 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  49.02 
 
 
626 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  48.18 
 
 
639 aa  539  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  50.43 
 
 
610 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  50.43 
 
 
610 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  49.02 
 
 
665 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  50.43 
 
 
610 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  50.43 
 
 
610 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  50.43 
 
 
610 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  50.43 
 
 
610 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  50.43 
 
 
610 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  51.84 
 
 
616 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  51.37 
 
 
593 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  51.26 
 
 
596 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  50.34 
 
 
598 aa  531  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  49.41 
 
 
598 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  48.87 
 
 
623 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  47.82 
 
 
636 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  48.84 
 
 
611 aa  525  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  47.78 
 
 
626 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  48.38 
 
 
623 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  49.33 
 
 
619 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  48.83 
 
 
602 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  45.95 
 
 
597 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  46.39 
 
 
602 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  48.99 
 
 
596 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  46.38 
 
 
619 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  46.55 
 
 
619 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  46.94 
 
 
593 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17860  glycosyl hydrolase, glucoamylase  49.09 
 
 
627 aa  508  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  47.6 
 
 
594 aa  510  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  47.41 
 
 
605 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  47.79 
 
 
613 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  48.67 
 
 
605 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  45.81 
 
 
632 aa  503  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  46.43 
 
 
617 aa  504  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  46.15 
 
 
600 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  44.96 
 
 
614 aa  502  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  46.64 
 
 
605 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  48.5 
 
 
602 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  48.5 
 
 
602 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  44.75 
 
 
629 aa  500  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  46.11 
 
 
601 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  48.41 
 
 
601 aa  499  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  48.08 
 
 
600 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  45.12 
 
 
601 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  45.65 
 
 
620 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  46.9 
 
 
608 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  46.43 
 
 
610 aa  498  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  44.93 
 
 
627 aa  491  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  50.17 
 
 
602 aa  492  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  46.19 
 
 
603 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  46.01 
 
 
629 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  46.24 
 
 
626 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  46.36 
 
 
598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  46.45 
 
 
598 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  45.35 
 
 
599 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  45.66 
 
 
727 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  42.86 
 
 
850 aa  443  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  42.74 
 
 
592 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  43.37 
 
 
596 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  42.74 
 
 
592 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  39.46 
 
 
612 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  42.59 
 
 
596 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  41.15 
 
 
608 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  41.15 
 
 
608 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  39.29 
 
 
612 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  41.04 
 
 
595 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  40.36 
 
 
607 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  38.55 
 
 
609 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  38.49 
 
 
668 aa  379  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  38.14 
 
 
677 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  38.14 
 
 
677 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  39.1 
 
 
613 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  38.14 
 
 
677 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  38.28 
 
 
642 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  38.37 
 
 
672 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  41.08 
 
 
617 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  39.22 
 
 
619 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  37.87 
 
 
610 aa  362  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  39.32 
 
 
635 aa  360  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>