215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03970 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  100 
 
 		 639 aa  1281    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17860  glycosyl hydrolase, glucoamylase  58.61 
 
 		 627 aa  728    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  51.87 
 
 		 636 aa  627  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  48.27 
 
 		 632 aa  590  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  49.13 
 
 		 605 aa  579  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  48.75 
 
 		 593 aa  556  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  50.64 
 
 		 604 aa  553  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  48.18 
 
 		 629 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  47.36 
 
 		 589 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  47.72 
 
 		 643 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  45.35 
 
 		 586 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  45.57 
 
 		 598 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  44.81 
 
 		 623 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  47.39 
 
 		 600 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  44.18 
 
 		 601 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  45.27 
 
 		 623 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  45.12 
 
 		 619 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  43.02 
 
 		 598 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  44.3 
 
 		 597 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  44.71 
 
 		 602 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  45.27 
 
 		 616 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  43.23 
 
 		 628 aa  477  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  44.02 
 
 		 609 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  43.78 
 
 		 602 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  44.02 
 
 		 609 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  42.31 
 
 		 629 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  42.92 
 
 		 605 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  44.02 
 
 		 609 aa  475  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  43.86 
 
 		 609 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  45.28 
 
 		 602 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  43.93 
 
 		 605 aa  475  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  44.81 
 
 		 602 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  43.79 
 
 		 609 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  43.38 
 
 		 609 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  44.39 
 
 		 596 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  42.86 
 
 		 596 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  43.86 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  42.81 
 
 		 619 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  43.86 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  42.81 
 
 		 619 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  43.46 
 
 		 600 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  42.92 
 
 		 613 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  43.22 
 
 		 611 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  43.86 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  43.86 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  43.86 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  43.86 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  43.86 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  43.7 
 
 		 665 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  42.65 
 
 		 626 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  42.2 
 
 		 593 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  42.02 
 
 		 620 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  42.14 
 
 		 627 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  42.04 
 
 		 626 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  41.82 
 
 		 608 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  42.65 
 
 		 594 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  42.16 
 
 		 605 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  42.15 
 
 		 614 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  41.76 
 
 		 601 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  43.55 
 
 		 610 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  41.29 
 
 		 627 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  41.19 
 
 		 602 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  42.19 
 
 		 601 aa  445  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  41.99 
 
 		 611 aa  445  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  41.48 
 
 		 601 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  41.34 
 
 		 629 aa  445  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  42.36 
 
 		 599 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  42.13 
 
 		 602 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  41.35 
 
 		 598 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  38.7 
 
 		 597 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  40.41 
 
 		 626 aa  426  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  40.42 
 
 		 617 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  40.63 
 
 		 598 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  39.91 
 
 		 600 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  40.6 
 
 		 603 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  38.74 
 
 		 629 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  40.03 
 
 		 850 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  39.68 
 
 		 592 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  39.52 
 
 		 592 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  41.76 
 
 		 727 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  39.84 
 
 		 596 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  39.5 
 
 		 596 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  34.16 
 
 		 612 aa  357  5e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  36.6 
 
 		 679 aa  349  7e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  38.43 
 
 		 645 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  35.55 
 
 		 612 aa  347  5e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  36.57 
 
 		 677 aa  346  7e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  36.38 
 
 		 625 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  36.42 
 
 		 677 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  36.42 
 
 		 677 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  36.83 
 
 		 595 aa  342  9e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  36.6 
 
 		 668 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  37.93 
 
 		 617 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  37.93 
 
 		 617 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  39.24 
 
 		 599 aa  340  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  37.11 
 
 		 662 aa  339  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  38.36 
 
 		 596 aa  336  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  36.43 
 
 		 642 aa  333  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  37.44 
 
 		 621 aa  333  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  36.14 
 
 		 672 aa  332  9e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>