216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2783 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  64.9 
 
 
635 aa  811    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  68.26 
 
 
679 aa  899    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  60.78 
 
 
645 aa  764    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  54.47 
 
 
645 aa  662    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  82.03 
 
 
677 aa  1094    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9017  glycoside hydrolase  64.04 
 
 
639 aa  795    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  100 
 
 
662 aa  1364    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  62.6 
 
 
629 aa  790    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  64.53 
 
 
636 aa  818    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  82.03 
 
 
677 aa  1094    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  81.4 
 
 
668 aa  1082    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  69.29 
 
 
659 aa  883    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  81.72 
 
 
677 aa  1090    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  81.4 
 
 
672 aa  1082    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  62.05 
 
 
636 aa  820    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  81.24 
 
 
642 aa  1072    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  39.56 
 
 
613 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  40.89 
 
 
619 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  39.66 
 
 
612 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  41.22 
 
 
586 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  42.25 
 
 
610 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  41 
 
 
625 aa  412  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  38.81 
 
 
627 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  41.5 
 
 
601 aa  403  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  40.66 
 
 
596 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  40.58 
 
 
600 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  39.62 
 
 
605 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  39.78 
 
 
605 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  39.55 
 
 
609 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  39.55 
 
 
597 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  40.1 
 
 
598 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  37.96 
 
 
612 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  38.82 
 
 
623 aa  399  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  39.77 
 
 
594 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  38.41 
 
 
605 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  37.36 
 
 
612 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  38.4 
 
 
602 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  39.9 
 
 
611 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  38.44 
 
 
623 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  38.82 
 
 
613 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  37.64 
 
 
617 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  37.14 
 
 
595 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  38.83 
 
 
598 aa  388  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  39.49 
 
 
594 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  39.78 
 
 
599 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  37.52 
 
 
599 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  38.36 
 
 
594 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  37.18 
 
 
596 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  39.68 
 
 
602 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  38.21 
 
 
608 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  38.47 
 
 
608 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  37.9 
 
 
614 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  37.15 
 
 
619 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  37.17 
 
 
626 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  38.03 
 
 
868 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  39.27 
 
 
613 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  37.42 
 
 
620 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  38.52 
 
 
603 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  38.05 
 
 
599 aa  372  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  37.6 
 
 
602 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  37.1 
 
 
598 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  39.9 
 
 
602 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  37.19 
 
 
601 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  39.74 
 
 
602 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4565  glycoside hydrolase 15-related protein  38.49 
 
 
623 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  36.38 
 
 
627 aa  369  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  33.55 
 
 
606 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  38.1 
 
 
629 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  36.66 
 
 
629 aa  365  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  38.93 
 
 
616 aa  365  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  39.57 
 
 
600 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  36.42 
 
 
850 aa  365  2e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  36.41 
 
 
601 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  36.42 
 
 
619 aa  363  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  36.45 
 
 
617 aa  364  4e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  37.82 
 
 
609 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  36.42 
 
 
619 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  38.55 
 
 
611 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  37.09 
 
 
600 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  37.2 
 
 
628 aa  362  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  37.02 
 
 
598 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  37.54 
 
 
604 aa  361  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  37.28 
 
 
593 aa  361  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  37.83 
 
 
596 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  37.38 
 
 
869 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  36.25 
 
 
625 aa  360  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  37.1 
 
 
626 aa  360  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  38.25 
 
 
610 aa  359  7e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  38.25 
 
 
610 aa  359  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  38.25 
 
 
610 aa  359  7e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  38.25 
 
 
610 aa  359  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  38.25 
 
 
610 aa  359  7e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  38.25 
 
 
610 aa  359  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  38.25 
 
 
610 aa  359  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  37.21 
 
 
609 aa  360  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  37.3 
 
 
611 aa  359  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  38.16 
 
 
608 aa  359  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  36.88 
 
 
609 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  36.55 
 
 
626 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  36.33 
 
 
602 aa  357  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>