214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2309 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  53.51 
 
 
609 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  55.91 
 
 
596 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  54.1 
 
 
619 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  53.15 
 
 
605 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  55.31 
 
 
610 aa  646    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  54.3 
 
 
609 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  54.47 
 
 
598 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  53.52 
 
 
617 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  55.31 
 
 
610 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  56.22 
 
 
598 aa  655    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  53.51 
 
 
609 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  100 
 
 
627 aa  1289    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  54.3 
 
 
665 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  53.62 
 
 
623 aa  659    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  53.33 
 
 
628 aa  637    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  54.64 
 
 
609 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  53.62 
 
 
611 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  53.42 
 
 
600 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  55.39 
 
 
626 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  55.78 
 
 
593 aa  679    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  54.61 
 
 
602 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  53.34 
 
 
609 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  53.3 
 
 
623 aa  653    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  54.13 
 
 
611 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  54.23 
 
 
597 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  53.51 
 
 
609 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  54.05 
 
 
627 aa  651    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  55.31 
 
 
610 aa  646    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  54.71 
 
 
626 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  55.31 
 
 
610 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  55.31 
 
 
610 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  55.31 
 
 
610 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  55.31 
 
 
610 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  53.49 
 
 
629 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  53.9 
 
 
602 aa  638    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  54.74 
 
 
596 aa  642    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  53.32 
 
 
620 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  52.81 
 
 
605 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  52.97 
 
 
601 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  52.63 
 
 
619 aa  628  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  54.13 
 
 
601 aa  629  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  52.8 
 
 
619 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  52.99 
 
 
601 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  52.58 
 
 
597 aa  626  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  52.42 
 
 
613 aa  626  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  54.33 
 
 
586 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  52.61 
 
 
602 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  53.56 
 
 
600 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  53.96 
 
 
616 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  52.6 
 
 
629 aa  617  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  52.69 
 
 
608 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  54.11 
 
 
603 aa  615  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  52.74 
 
 
602 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  52.09 
 
 
605 aa  609  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  52.74 
 
 
602 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  55.85 
 
 
601 aa  611  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  52.63 
 
 
600 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  52.45 
 
 
594 aa  600  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  50.82 
 
 
614 aa  595  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  51.66 
 
 
598 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  50.57 
 
 
629 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  52.12 
 
 
602 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  50.84 
 
 
610 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  50.17 
 
 
626 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  50 
 
 
589 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  51.18 
 
 
599 aa  570  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  50 
 
 
598 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  54.13 
 
 
727 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  46.36 
 
 
850 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  46.77 
 
 
604 aa  511  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  45.49 
 
 
592 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  44.07 
 
 
596 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  45.32 
 
 
592 aa  502  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  45.71 
 
 
593 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  43.35 
 
 
605 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  45.59 
 
 
643 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  44.39 
 
 
596 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  44.93 
 
 
629 aa  477  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  42.17 
 
 
636 aa  463  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  40.39 
 
 
612 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  41.29 
 
 
639 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  40.95 
 
 
632 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  39.64 
 
 
612 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  38.08 
 
 
612 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  41.54 
 
 
625 aa  426  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  42.04 
 
 
610 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  40.22 
 
 
672 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  40.38 
 
 
668 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  40.22 
 
 
642 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  39.02 
 
 
613 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  39.33 
 
 
894 aa  409  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  38.99 
 
 
677 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  38.99 
 
 
677 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  38.99 
 
 
677 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17860  glycosyl hydrolase, glucoamylase  40.06 
 
 
627 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  39.37 
 
 
608 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  40.33 
 
 
599 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  38.94 
 
 
596 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  39.27 
 
 
613 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  40.26 
 
 
679 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>