218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3547 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  62.56 
 
 
645 aa  780    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  65.7 
 
 
636 aa  832    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  69.39 
 
 
659 aa  882    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9017  glycoside hydrolase  65.11 
 
 
639 aa  802    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  68.1 
 
 
679 aa  914    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  65.29 
 
 
635 aa  824    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  61.86 
 
 
636 aa  807    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
677 aa  1390    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  82.03 
 
 
662 aa  1070    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  54.36 
 
 
645 aa  672    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
677 aa  1390    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  88.54 
 
 
668 aa  1229    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  99.7 
 
 
677 aa  1387    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  87.65 
 
 
672 aa  1222    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  62.62 
 
 
629 aa  806    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  88.78 
 
 
642 aa  1175    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  42.25 
 
 
586 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  40.63 
 
 
613 aa  426  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  41.32 
 
 
600 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  41.81 
 
 
596 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  38.99 
 
 
627 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  39.27 
 
 
612 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  39.97 
 
 
605 aa  405  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  41.4 
 
 
610 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  39.26 
 
 
609 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  37.69 
 
 
612 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  38.31 
 
 
595 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  38.77 
 
 
613 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  40.23 
 
 
598 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  37.8 
 
 
596 aa  398  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  40.03 
 
 
597 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  38.51 
 
 
599 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  39.03 
 
 
605 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  39.9 
 
 
625 aa  391  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  41.18 
 
 
601 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  39.1 
 
 
594 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  39.33 
 
 
619 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  38.87 
 
 
605 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  34.79 
 
 
606 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  38.21 
 
 
602 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  38.36 
 
 
623 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  39.35 
 
 
598 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  37.87 
 
 
617 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  38.66 
 
 
623 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  40.07 
 
 
602 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  36.48 
 
 
612 aa  382  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  38.51 
 
 
868 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  37.89 
 
 
608 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  38.25 
 
 
608 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  37.72 
 
 
594 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  37.42 
 
 
601 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  38.29 
 
 
850 aa  378  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  39.9 
 
 
610 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  39.9 
 
 
610 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  38.51 
 
 
601 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  38.19 
 
 
614 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  37.94 
 
 
599 aa  375  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  39.9 
 
 
610 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  39.9 
 
 
610 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  39.9 
 
 
610 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  39.9 
 
 
610 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  39.9 
 
 
610 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  38.61 
 
 
598 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  38.07 
 
 
609 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  39.42 
 
 
665 aa  372  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  36.92 
 
 
602 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  38.73 
 
 
611 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  37.46 
 
 
594 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  36.83 
 
 
619 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  37.42 
 
 
602 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  37.58 
 
 
619 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  38.5 
 
 
603 aa  369  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  38.09 
 
 
599 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  37.89 
 
 
609 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  37.77 
 
 
620 aa  365  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  37.89 
 
 
609 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  37.42 
 
 
619 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  37.6 
 
 
609 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  38.57 
 
 
613 aa  365  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  37.72 
 
 
601 aa  364  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  38.46 
 
 
616 aa  363  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  38.34 
 
 
629 aa  364  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  37.62 
 
 
609 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  37.89 
 
 
609 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  37.32 
 
 
611 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  36.94 
 
 
628 aa  361  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  36.42 
 
 
627 aa  360  3e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  39.24 
 
 
602 aa  361  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  39.02 
 
 
602 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  37.38 
 
 
626 aa  360  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  37.9 
 
 
626 aa  360  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4565  glycoside hydrolase 15-related protein  38.45 
 
 
623 aa  360  6e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  38.89 
 
 
608 aa  359  7e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  38.14 
 
 
629 aa  359  8e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  37.14 
 
 
626 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  35.63 
 
 
617 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  37.66 
 
 
604 aa  359  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  36.28 
 
 
629 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1144  glycoside hydrolase 15-related protein  33.24 
 
 
696 aa  358  1.9999999999999998e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  39.51 
 
 
600 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>