205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3936 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  57.17 
 
 
617 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  55.83 
 
 
619 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
603 aa  1229    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  53.07 
 
 
609 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  51.97 
 
 
608 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  51.47 
 
 
608 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  51.32 
 
 
625 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  49.92 
 
 
623 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  51.16 
 
 
613 aa  560  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  48.2 
 
 
612 aa  544  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  44.01 
 
 
606 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  48.99 
 
 
613 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  47.91 
 
 
599 aa  512  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  48.43 
 
 
610 aa  510  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  44.59 
 
 
612 aa  482  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  45.38 
 
 
594 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  45.38 
 
 
594 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05440  glycosyl hydrolase, putative  41.51 
 
 
656 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  44.01 
 
 
601 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  42.23 
 
 
894 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  41.74 
 
 
625 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  42.31 
 
 
624 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  41.48 
 
 
586 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1640  glycoside hydrolase 15-related  41.68 
 
 
887 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  41.92 
 
 
595 aa  398  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0987  glycoside hydrolase 15-related  41.79 
 
 
886 aa  399  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  39.93 
 
 
598 aa  392  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  40.1 
 
 
602 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  40.7 
 
 
596 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  40.1 
 
 
602 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  40.51 
 
 
623 aa  389  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  40.63 
 
 
596 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  39.76 
 
 
598 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  39.76 
 
 
600 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  39.74 
 
 
623 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  38.91 
 
 
627 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  40.56 
 
 
619 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  40.03 
 
 
605 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  40.49 
 
 
679 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  39.54 
 
 
609 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  39.83 
 
 
611 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  39.44 
 
 
868 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  39.46 
 
 
600 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  40.5 
 
 
645 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  38.45 
 
 
617 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  38.39 
 
 
612 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  38.33 
 
 
593 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  40.1 
 
 
607 aa  375  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  39.9 
 
 
597 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  39.9 
 
 
627 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  39.8 
 
 
609 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  39.73 
 
 
602 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  40.44 
 
 
602 aa  372  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  38.92 
 
 
609 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  38.71 
 
 
609 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  37.98 
 
 
627 aa  368  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  38.55 
 
 
609 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  38.5 
 
 
677 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  38.99 
 
 
611 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  38.71 
 
 
609 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  38.5 
 
 
677 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  39.8 
 
 
617 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  38.5 
 
 
677 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  39.8 
 
 
635 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  38.14 
 
 
600 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  38.41 
 
 
608 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  38.13 
 
 
616 aa  365  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  38.82 
 
 
613 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  40.03 
 
 
621 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  39.8 
 
 
617 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  37.85 
 
 
672 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  37.48 
 
 
602 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  38.26 
 
 
665 aa  362  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  37.1 
 
 
602 aa  361  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  38.68 
 
 
610 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  38.95 
 
 
869 aa  360  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  38.68 
 
 
610 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  38.68 
 
 
610 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  38.68 
 
 
610 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  38.68 
 
 
610 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  38.68 
 
 
610 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  38.68 
 
 
610 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  39.08 
 
 
627 aa  360  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  38.18 
 
 
594 aa  361  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  38.89 
 
 
629 aa  359  7e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  38.34 
 
 
611 aa  359  8e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  39.34 
 
 
626 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  37.48 
 
 
668 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  38.45 
 
 
626 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  38.93 
 
 
599 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  38.24 
 
 
592 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  38.05 
 
 
642 aa  356  5e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  39.77 
 
 
621 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  39.12 
 
 
628 aa  355  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  38.52 
 
 
662 aa  355  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  38.11 
 
 
596 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1144  glycoside hydrolase 15-related protein  35.2 
 
 
696 aa  354  2.9999999999999997e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  37.81 
 
 
601 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  37.73 
 
 
592 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  38.3 
 
 
636 aa  352  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>