242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1640 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  58.61 
 
 		 894 aa  1087    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0987  glycoside hydrolase 15-related  60.34 
 
 		 886 aa  1068    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1640  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 887 aa  1843    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  36.07 
 
 		 869 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  36.07 
 
 		 868 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  41.96 
 
 		 625 aa  482  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  41.64 
 
 		 612 aa  452  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  42.42 
 
 		 617 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  41.08 
 
 		 586 aa  445  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  40.67 
 
 		 611 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  40.03 
 
 		 599 aa  432  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  39.64 
 
 		 613 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  40.37 
 
 		 619 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  39.19 
 
 		 612 aa  422  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  41.81 
 
 		 603 aa  422  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  39.31 
 
 		 612 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  38.83 
 
 		 597 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  38.75 
 
 		 627 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  37.46 
 
 		 602 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  40.1 
 
 		 610 aa  416  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  36.73 
 
 		 617 aa  411  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  37.21 
 
 		 596 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  40.5 
 
 		 598 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  39.04 
 
 		 595 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  38.7 
 
 		 594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  39.67 
 
 		 597 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  37.17 
 
 		 617 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  37.36 
 
 		 617 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  40.07 
 
 		 596 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  39.09 
 
 		 601 aa  406  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  38.39 
 
 		 619 aa  405  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  40.07 
 
 		 616 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  38.31 
 
 		 627 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  38.39 
 
 		 619 aa  406  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  38.37 
 
 		 598 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  35.76 
 
 		 850 aa  403  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1144  glycoside hydrolase 15-related protein  36.09 
 
 		 696 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  37.94 
 
 		 619 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  37.09 
 
 		 629 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  37.69 
 
 		 620 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  38.99 
 
 		 601 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  36.9 
 
 		 602 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  38.1 
 
 		 605 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  37.56 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  36.61 
 
 		 623 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  37.56 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  38.07 
 
 		 609 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  36.79 
 
 		 609 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  37.24 
 
 		 665 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  36.36 
 
 		 621 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  37.89 
 
 		 628 aa  399  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  38.22 
 
 		 600 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  38.46 
 
 		 601 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  36.57 
 
 		 623 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  37.56 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  37.56 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  38.91 
 
 		 596 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  37.56 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  37.56 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  37.56 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  36.83 
 
 		 609 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  36.68 
 
 		 609 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  36.87 
 
 		 626 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  36.5 
 
 		 599 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  37.42 
 
 		 608 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  37.58 
 
 		 629 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  36.51 
 
 		 609 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  37.48 
 
 		 608 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  37.5 
 
 		 602 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  37.5 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  37.4 
 
 		 611 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  36.35 
 
 		 609 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  38.71 
 
 		 600 aa  392  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  36.56 
 
 		 611 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  36.51 
 
 		 609 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  38.07 
 
 		 645 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  38.5 
 
 		 602 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  38.29 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  36.91 
 
 		 608 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  36.72 
 
 		 629 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  36.15 
 
 		 606 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  36.92 
 
 		 613 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  36.54 
 
 		 626 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  37.34 
 
 		 602 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  39.02 
 
 		 602 aa  389  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  39.1 
 
 		 607 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  37.02 
 
 		 613 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  39.28 
 
 		 610 aa  389  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  38.36 
 
 		 605 aa  386  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  38.58 
 
 		 605 aa  386  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  37.54 
 
 		 603 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  35.86 
 
 		 600 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  37.01 
 
 		 626 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  37.56 
 
 		 598 aa  376  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  37.63 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  36.68 
 
 		 593 aa  375  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  35.7 
 
 		 679 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  37.07 
 
 		 605 aa  376  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  36.46 
 
 		 598 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  36.65 
 
 		 677 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>