230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0290 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  65.24 
 
 		 868 aa  1145    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 869 aa  1793    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  36.66 
 
 		 894 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0987  glycoside hydrolase 15-related  36.17 
 
 		 886 aa  545  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1640  glycoside hydrolase 15-related  36.06 
 
 		 887 aa  519  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  39.04 
 
 		 625 aa  431  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  38.42 
 
 		 598 aa  405  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  39.02 
 
 		 612 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  39.47 
 
 		 600 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  40.78 
 
 		 601 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  40.07 
 
 		 612 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  37.85 
 
 		 612 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  38.31 
 
 		 601 aa  399  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  39.77 
 
 		 586 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  40.46 
 
 		 610 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  39.14 
 
 		 613 aa  392  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  38.99 
 
 		 597 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  36.51 
 
 		 627 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  38.27 
 
 		 617 aa  388  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  39.33 
 
 		 602 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  37.7 
 
 		 602 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  39.06 
 
 		 599 aa  389  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  37.09 
 
 		 605 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  38.33 
 
 		 609 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  37.83 
 
 		 595 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  39.05 
 
 		 645 aa  382  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  37.48 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  37.48 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  37.18 
 
 		 609 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  38.15 
 
 		 627 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  37.4 
 
 		 613 aa  382  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  38.97 
 
 		 607 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  36.83 
 
 		 623 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  38.06 
 
 		 602 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  37.48 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  37.48 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  37.48 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  37.48 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  37.48 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  37.67 
 
 		 619 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  35.69 
 
 		 850 aa  381  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 605 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  36.85 
 
 		 665 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  38.47 
 
 		 594 aa  379  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  38.8 
 
 		 626 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  37.71 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  36.82 
 
 		 596 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  37.22 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  38.47 
 
 		 594 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  37.48 
 
 		 605 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  36.69 
 
 		 609 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  37.01 
 
 		 597 aa  375  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  37.54 
 
 		 613 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  38.49 
 
 		 599 aa  376  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  36.69 
 
 		 609 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  37.81 
 
 		 602 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  36.18 
 
 		 606 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  37.81 
 
 		 602 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  37.75 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  36.1 
 
 		 602 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  37.16 
 
 		 623 aa  373  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  36.93 
 
 		 619 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  39.04 
 
 		 621 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  36.64 
 
 		 629 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  36.82 
 
 		 600 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  39.83 
 
 		 611 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  37.98 
 
 		 626 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  36.53 
 
 		 609 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  37.5 
 
 		 617 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  38.95 
 
 		 603 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  37.95 
 
 		 596 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  36.53 
 
 		 608 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  37.23 
 
 		 604 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  37.17 
 
 		 609 aa  369  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  35.58 
 
 		 629 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  37.85 
 
 		 601 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  37.93 
 
 		 598 aa  369  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  37.02 
 
 		 600 aa  366  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  35.4 
 
 		 598 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  35.86 
 
 		 601 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  37.09 
 
 		 611 aa  364  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  36.86 
 
 		 677 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  37.68 
 
 		 679 aa  364  5.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  36.7 
 
 		 677 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  36.7 
 
 		 677 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  37.18 
 
 		 642 aa  362  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  36.76 
 
 		 593 aa  362  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  37.44 
 
 		 672 aa  362  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  38.26 
 
 		 617 aa  360  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  36.73 
 
 		 594 aa  360  6e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  35.91 
 
 		 608 aa  360  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  35.49 
 
 		 619 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  35.23 
 
 		 626 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  38 
 
 		 617 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  37.38 
 
 		 662 aa  358  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  35.27 
 
 		 628 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  35.49 
 
 		 619 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  36.96 
 
 		 668 aa  358  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  38.17 
 
 		 645 aa  357  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  35.39 
 
 		 608 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>