65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7572 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  52.57 
 
 
802 aa  832    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  52.82 
 
 
803 aa  828    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 
801 aa  1634    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  57.18 
 
 
800 aa  868    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  38.36 
 
 
814 aa  557  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  40.79 
 
 
835 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  41.24 
 
 
786 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  41.24 
 
 
786 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  40.2 
 
 
761 aa  522  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  42.84 
 
 
692 aa  487  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  43.13 
 
 
681 aa  485  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  38.79 
 
 
798 aa  447  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  37.06 
 
 
715 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  35.05 
 
 
881 aa  389  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  33.73 
 
 
882 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  33.73 
 
 
881 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.73 
 
 
882 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  33.51 
 
 
1160 aa  350  6e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.45 
 
 
837 aa  349  9e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.15 
 
 
838 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.06 
 
 
860 aa  346  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  31.39 
 
 
847 aa  340  8e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.15 
 
 
838 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.63 
 
 
840 aa  332  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.26 
 
 
820 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.7 
 
 
858 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.96 
 
 
808 aa  325  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.96 
 
 
808 aa  325  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.33 
 
 
858 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.33 
 
 
858 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.74 
 
 
833 aa  320  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.26 
 
 
821 aa  315  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.2 
 
 
841 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.39 
 
 
803 aa  303  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.22 
 
 
817 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.93 
 
 
777 aa  286  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.76 
 
 
1505 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  29.46 
 
 
1592 aa  259  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.16 
 
 
1132 aa  247  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.41 
 
 
433 aa  194  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.26 
 
 
430 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  24.12 
 
 
647 aa  80.1  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  22.93 
 
 
615 aa  74.7  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  24.29 
 
 
668 aa  73.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  21.36 
 
 
611 aa  72  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  25.06 
 
 
621 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  25.34 
 
 
604 aa  70.1  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  21.61 
 
 
615 aa  69.3  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  26.53 
 
 
647 aa  67.8  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  22.77 
 
 
622 aa  67.4  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  23.58 
 
 
627 aa  67.4  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  25.98 
 
 
621 aa  65.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  25.19 
 
 
621 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  23.04 
 
 
649 aa  63.9  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  22.57 
 
 
621 aa  62.4  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  23.28 
 
 
645 aa  59.7  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  24.62 
 
 
644 aa  58.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  25.06 
 
 
644 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.76 
 
 
569 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  22.54 
 
 
673 aa  54.7  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  25.66 
 
 
650 aa  53.9  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1536  hypothetical protein  37.29 
 
 
180 aa  53.5  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.0276141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1858  hypothetical protein  37.29 
 
 
180 aa  53.5  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0683623  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  24.33 
 
 
622 aa  48.9  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  25.4 
 
 
610 aa  48.1  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>