56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2224 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 786 aa  1603    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  100 
 
 		 786 aa  1603    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  48.4 
 
 		 835 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  46.32 
 
 		 761 aa  623  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  44.16 
 
 		 800 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  41.38 
 
 		 803 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  41.38 
 
 		 802 aa  561  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  44.39 
 
 		 798 aa  548  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  41.24 
 
 		 801 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.19 
 
 		 814 aa  469  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  39.83 
 
 		 692 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  39.97 
 
 		 681 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.61 
 
 		 715 aa  349  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  30.96 
 
 		 881 aa  279  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  30.49 
 
 		 881 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.49 
 
 		 882 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  30.35 
 
 		 882 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.74 
 
 		 860 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  29.69 
 
 		 1160 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  30.9 
 
 		 1592 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.07 
 
 		 1505 aa  240  6.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.59 
 
 		 808 aa  235  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.59 
 
 		 808 aa  235  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.16 
 
 		 803 aa  233  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.4 
 
 		 820 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.09 
 
 		 837 aa  231  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.72 
 
 		 833 aa  227  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.94 
 
 		 838 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.93 
 
 		 821 aa  224  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.62 
 
 		 840 aa  223  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.5 
 
 		 841 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.23 
 
 		 838 aa  222  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  25.84 
 
 		 847 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.8 
 
 		 777 aa  213  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.3 
 
 		 817 aa  208  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.84 
 
 		 1132 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.75 
 
 		 858 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.62 
 
 		 858 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.62 
 
 		 858 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1536  hypothetical protein  67.68 
 
 		 180 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.0276141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1858  hypothetical protein  67.68 
 
 		 180 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0683623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.59 
 
 		 433 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.06 
 
 		 430 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  28.57 
 
 		 673 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  26.6 
 
 		 642 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  23.64 
 
 		 621 aa  57.4  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  25.73 
 
 		 647 aa  57  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  22.75 
 
 		 621 aa  56.2  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  22.76 
 
 		 621 aa  55.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  22.57 
 
 		 611 aa  55.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  22.64 
 
 		 644 aa  55.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  23.56 
 
 		 604 aa  52.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  23.86 
 
 		 644 aa  48.5  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  22.63 
 
 		 627 aa  45.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  21.74 
 
 		 621 aa  44.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  21.46 
 
 		 645 aa  44.3  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>