216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1322 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0554  glycoside hydrolase 15-related protein  61.84 
 
 		 578 aa  758    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000579959  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1322  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 565 aa  1154    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.033472  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  44.92 
 
 		 584 aa  479  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0989  glycoside hydrolase 15-related  43.97 
 
 		 583 aa  480  1e-134  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.422576  normal  0.0726488 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  35.99 
 
 		 850 aa  280  5e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  32.83 
 
 		 868 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  31.94 
 
 		 599 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 		 627 aa  262  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  32.27 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  33.39 
 
 		 613 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  32.05 
 
 		 613 aa  256  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  33.44 
 
 		 595 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  31.17 
 
 		 598 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  33.61 
 
 		 611 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  33.33 
 
 		 629 aa  252  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  31.85 
 
 		 632 aa  249  7e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  31.55 
 
 		 614 aa  249  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  32.44 
 
 		 601 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  30.67 
 
 		 626 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  32.05 
 
 		 617 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  32.49 
 
 		 597 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  31.89 
 
 		 612 aa  246  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  31.56 
 
 		 620 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  30.59 
 
 		 600 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  32.46 
 
 		 609 aa  242  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  32.24 
 
 		 609 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  31.51 
 
 		 619 aa  240  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  32.24 
 
 		 628 aa  240  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  29.73 
 
 		 594 aa  240  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  31.72 
 
 		 600 aa  240  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  32.13 
 
 		 611 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  30.63 
 
 		 602 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  30.74 
 
 		 602 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  31.51 
 
 		 619 aa  239  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  32.24 
 
 		 609 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  32.72 
 
 		 610 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  30.51 
 
 		 594 aa  237  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  32.72 
 
 		 610 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  31.97 
 
 		 609 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  30.65 
 
 		 645 aa  237  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  30.37 
 
 		 599 aa  237  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  31.97 
 
 		 609 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  32.72 
 
 		 610 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  32.72 
 
 		 610 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  32.72 
 
 		 610 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  32.72 
 
 		 610 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  32.72 
 
 		 610 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  31.41 
 
 		 613 aa  236  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  31.23 
 
 		 602 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  31.4 
 
 		 602 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  31.88 
 
 		 629 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  31.64 
 
 		 609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  30.64 
 
 		 608 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  31 
 
 		 589 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  30.3 
 
 		 598 aa  234  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  32.22 
 
 		 665 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  30.64 
 
 		 586 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  30.15 
 
 		 601 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  31.22 
 
 		 629 aa  233  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  30.24 
 
 		 612 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  29.44 
 
 		 869 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  30.92 
 
 		 605 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  30.56 
 
 		 617 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  30.99 
 
 		 617 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  29.8 
 
 		 612 aa  230  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 		 605 aa  230  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  30.42 
 
 		 609 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  30.62 
 
 		 600 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  31.06 
 
 		 608 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 608 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  31.25 
 
 		 625 aa  229  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  28.99 
 
 		 679 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  31.16 
 
 		 643 aa  226  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  30.81 
 
 		 597 aa  226  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  31.33 
 
 		 603 aa  226  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  30.55 
 
 		 621 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  31.64 
 
 		 604 aa  226  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  31.17 
 
 		 619 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  30.62 
 
 		 627 aa  224  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  29.12 
 
 		 606 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  30.34 
 
 		 599 aa  224  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  29.42 
 
 		 601 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  30.37 
 
 		 594 aa  223  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  30.12 
 
 		 610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  30.57 
 
 		 639 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0987  glycoside hydrolase 15-related  29.88 
 
 		 886 aa  221  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  29.78 
 
 		 893 aa  221  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  30.17 
 
 		 601 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  30.13 
 
 		 786 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  29.59 
 
 		 596 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  30.28 
 
 		 593 aa  219  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  29.05 
 
 		 642 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  30.77 
 
 		 610 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  30.77 
 
 		 596 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  31.07 
 
 		 626 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  30.1 
 
 		 602 aa  217  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  30.41 
 
 		 596 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  30.41 
 
 		 623 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  30.27 
 
 		 605 aa  216  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  29.68 
 
 		 623 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>