285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3889 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  85.57 
 
 
876 aa  1505    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  52.04 
 
 
842 aa  856    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  51.46 
 
 
867 aa  814    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  51.11 
 
 
867 aa  818    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  51.3 
 
 
867 aa  841    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  55 
 
 
786 aa  687    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  100 
 
 
893 aa  1795    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  51.56 
 
 
847 aa  839    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  51.92 
 
 
844 aa  838    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  36.67 
 
 
610 aa  342  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  36.67 
 
 
610 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 
610 aa  342  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  36.67 
 
 
610 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  36.67 
 
 
610 aa  342  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  36.67 
 
 
610 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  36.67 
 
 
610 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  35.77 
 
 
665 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  36.48 
 
 
609 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  36.45 
 
 
611 aa  336  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  37.04 
 
 
625 aa  335  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  36.39 
 
 
609 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  36.29 
 
 
609 aa  333  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  36.23 
 
 
598 aa  331  4e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  36.29 
 
 
609 aa  331  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  36.29 
 
 
609 aa  331  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  35.73 
 
 
601 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  36.29 
 
 
609 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  34.91 
 
 
894 aa  327  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  36.89 
 
 
598 aa  326  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  34.33 
 
 
626 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  35.17 
 
 
614 aa  322  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  35.39 
 
 
594 aa  319  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  36.3 
 
 
586 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  34.78 
 
 
612 aa  318  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  36.13 
 
 
600 aa  317  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  34.12 
 
 
627 aa  317  5e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  33.88 
 
 
626 aa  316  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  34.89 
 
 
598 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  36.26 
 
 
602 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  34.53 
 
 
629 aa  315  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  34.8 
 
 
602 aa  313  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  35.46 
 
 
596 aa  312  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  35.31 
 
 
595 aa  310  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  34.4 
 
 
619 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  35.93 
 
 
613 aa  310  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  34.23 
 
 
619 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  35.18 
 
 
628 aa  308  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  34.83 
 
 
605 aa  308  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  32.65 
 
 
617 aa  307  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  33.77 
 
 
619 aa  306  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  33.56 
 
 
620 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  35.13 
 
 
593 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  35.76 
 
 
603 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  33.67 
 
 
608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  33.89 
 
 
627 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  34.07 
 
 
605 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0987  glycoside hydrolase 15-related  34.29 
 
 
886 aa  304  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  33.45 
 
 
608 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  35.88 
 
 
600 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  35.82 
 
 
602 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  34.18 
 
 
629 aa  302  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  34.95 
 
 
610 aa  302  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  34.46 
 
 
608 aa  301  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  30.37 
 
 
606 aa  301  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  32.95 
 
 
623 aa  301  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  35.08 
 
 
589 aa  301  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  34.54 
 
 
611 aa  300  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  33.05 
 
 
609 aa  299  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  35.48 
 
 
602 aa  300  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  35.33 
 
 
607 aa  300  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  34.06 
 
 
597 aa  299  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  33.84 
 
 
596 aa  298  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  34.99 
 
 
599 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  34.72 
 
 
868 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  34.97 
 
 
596 aa  298  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  33.66 
 
 
612 aa  298  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 
623 aa  298  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  34.61 
 
 
602 aa  298  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  33.73 
 
 
605 aa  297  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  33.39 
 
 
869 aa  297  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 
597 aa  297  6e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  33.83 
 
 
626 aa  297  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  33.5 
 
 
598 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  33 
 
 
600 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  35.19 
 
 
605 aa  296  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  32.94 
 
 
602 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  35.55 
 
 
617 aa  294  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  34.26 
 
 
621 aa  293  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  33.61 
 
 
599 aa  293  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  32.33 
 
 
629 aa  292  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  32.3 
 
 
612 aa  292  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  33.89 
 
 
611 aa  292  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  33.55 
 
 
850 aa  291  5.0000000000000004e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  34.45 
 
 
601 aa  291  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  34.22 
 
 
601 aa  291  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  33.5 
 
 
596 aa  290  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  34.44 
 
 
601 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  33.93 
 
 
610 aa  288  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  34.11 
 
 
599 aa  287  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  33.17 
 
 
613 aa  287  7e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>