More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  53.82 
 
 		 876 aa  830    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  75.42 
 
 		 842 aa  1301    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  58.46 
 
 		 867 aa  979    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  100 
 
 		 844 aa  1688    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  56.8 
 
 		 786 aa  887    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  79.81 
 
 		 847 aa  1363    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  59.46 
 
 		 867 aa  987    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  51.92 
 
 		 893 aa  834    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  60.05 
 
 		 867 aa  993    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  38.29 
 
 		 665 aa  361  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  38.75 
 
 		 610 aa  360  9e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  38.75 
 
 		 610 aa  360  9e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  38.75 
 
 		 610 aa  360  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  38.75 
 
 		 610 aa  360  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  38.75 
 
 		 610 aa  360  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  38.75 
 
 		 610 aa  360  9e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  38.75 
 
 		 610 aa  360  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  38.58 
 
 		 609 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  37.9 
 
 		 609 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  38.41 
 
 		 609 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  37.9 
 
 		 611 aa  353  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  38.41 
 
 		 609 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  38.41 
 
 		 609 aa  350  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  36.12 
 
 		 627 aa  349  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  38.24 
 
 		 609 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  38.11 
 
 		 598 aa  346  8e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  37.52 
 
 		 594 aa  343  5e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  37.76 
 
 		 613 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  37.29 
 
 		 625 aa  342  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  37.84 
 
 		 598 aa  341  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  38.19 
 
 		 601 aa  341  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  38.63 
 
 		 616 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  38.34 
 
 		 608 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  36.42 
 
 		 586 aa  337  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  37.42 
 
 		 596 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  36.32 
 
 		 605 aa  335  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  34.67 
 
 		 894 aa  334  5e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  36.16 
 
 		 612 aa  334  5e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  35.58 
 
 		 627 aa  334  5e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  36.15 
 
 		 619 aa  331  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  36.04 
 
 		 602 aa  330  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  36.16 
 
 		 600 aa  330  8e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  35.98 
 
 		 619 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  37.07 
 
 		 626 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  36.44 
 
 		 605 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  36.12 
 
 		 626 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  32.13 
 
 		 606 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  37.97 
 
 		 598 aa  326  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  36.53 
 
 		 601 aa  325  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  37.54 
 
 		 596 aa  325  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  33.83 
 
 		 609 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  36.04 
 
 		 605 aa  322  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  37.1 
 
 		 602 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  36.67 
 
 		 639 aa  322  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  37.1 
 
 		 621 aa  321  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  36.62 
 
 		 589 aa  321  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  34.48 
 
 		 612 aa  320  6e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  35.64 
 
 		 601 aa  320  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  35.48 
 
 		 593 aa  320  7e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  36.41 
 
 		 850 aa  319  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  35.75 
 
 		 600 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  35.41 
 
 		 620 aa  320  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  34.97 
 
 		 597 aa  320  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  36.05 
 
 		 619 aa  318  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  34.97 
 
 		 602 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  35.38 
 
 		 610 aa  318  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  35.27 
 
 		 623 aa  318  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  37.35 
 
 		 626 aa  317  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  37.63 
 
 		 598 aa  317  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  37.21 
 
 		 617 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  35.53 
 
 		 601 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  35.83 
 
 		 629 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  34.36 
 
 		 617 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  35.27 
 
 		 623 aa  315  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  33.93 
 
 		 614 aa  314  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  35.44 
 
 		 869 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 617 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  37.35 
 
 		 617 aa  313  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  36.27 
 
 		 628 aa  312  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  36.2 
 
 		 603 aa  312  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  34.53 
 
 		 629 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  35.33 
 
 		 596 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1640  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 		 887 aa  311  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  35.46 
 
 		 595 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  36.09 
 
 		 645 aa  308  4.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  34.49 
 
 		 679 aa  307  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  34.62 
 
 		 613 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  35.45 
 
 		 636 aa  304  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  34.36 
 
 		 602 aa  304  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 619 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0987  glycoside hydrolase 15-related  33.11 
 
 		 886 aa  303  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  35.3 
 
 		 868 aa  302  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  35.37 
 
 		 602 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  35.84 
 
 		 659 aa  301  4e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  35.37 
 
 		 602 aa  301  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  35.17 
 
 		 599 aa  301  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  34.08 
 
 		 642 aa  300  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  35.08 
 
 		 600 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  37.42 
 
 		 643 aa  297  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  34.33 
 
 		 608 aa  297  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>