41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0817 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  100 
 
 
472 aa  906    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31600  glycosyl hydrolase, glucoamylase  47.45 
 
 
549 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  51.69 
 
 
487 aa  278  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0219  glycoside hydrolase 15-related  47.73 
 
 
402 aa  257  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0997463  hitchhiker  0.0053447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4222  glycoside hydrolase 15-related protein  43.54 
 
 
484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0187  glucoamylase-related glycosyl hydrolase-like protein  36.9 
 
 
485 aa  188  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10260  hypothetical protein  40.67 
 
 
466 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2413  glycoside hydrolase 15-related  39.39 
 
 
412 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  25.84 
 
 
615 aa  90.5  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  25 
 
 
644 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.48 
 
 
569 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  27.15 
 
 
604 aa  84  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  23.98 
 
 
644 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  25.8 
 
 
611 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  24.08 
 
 
645 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  30.67 
 
 
650 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  21.12 
 
 
647 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  26.25 
 
 
649 aa  68.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  23.48 
 
 
670 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  24.8 
 
 
621 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  24.35 
 
 
668 aa  67  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  28.13 
 
 
663 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  23.99 
 
 
621 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  22.14 
 
 
622 aa  63.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  24.07 
 
 
615 aa  61.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  22.91 
 
 
621 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  21.1 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  24.74 
 
 
621 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  25.74 
 
 
642 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  21.6 
 
 
627 aa  53.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  24.61 
 
 
647 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  27.12 
 
 
673 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  22.14 
 
 
622 aa  50.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  35.58 
 
 
621 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  34.11 
 
 
627 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  33.6 
 
 
627 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.41 
 
 
761 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0709  glycoside hydrolase 15-related  25 
 
 
706 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.901839  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  27.34 
 
 
623 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4565  glycoside hydrolase 15-related protein  37.37 
 
 
623 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.54 
 
 
692 aa  43.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>