124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1382 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  96.14 
 
 
621 aa  1246    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  70.05 
 
 
621 aa  959    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  53.78 
 
 
627 aa  706    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  95.33 
 
 
621 aa  1242    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
621 aa  1287    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  30.98 
 
 
604 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  29.76 
 
 
644 aa  295  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  28.92 
 
 
642 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  27.59 
 
 
644 aa  257  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  29.5 
 
 
647 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  29.57 
 
 
673 aa  231  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  26.73 
 
 
650 aa  216  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  26.11 
 
 
668 aa  213  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  26.37 
 
 
647 aa  208  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  26.18 
 
 
645 aa  204  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  25.64 
 
 
663 aa  204  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  24.58 
 
 
670 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  25.81 
 
 
611 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  27.2 
 
 
622 aa  179  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  25.37 
 
 
649 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.68 
 
 
569 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  26.8 
 
 
615 aa  156  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0134624 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  24.31 
 
 
615 aa  148  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  26.58 
 
 
622 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  27.82 
 
 
363 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  23.17 
 
 
610 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  23.58 
 
 
602 aa  84.3  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4631  glycoside hydrolase 15-related  25 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  24.82 
 
 
584 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  23.77 
 
 
589 aa  77  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0465  hypothetical protein  27.07 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0489  hypothetical protein  27.07 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  24.28 
 
 
604 aa  66.6  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.19 
 
 
801 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.32 
 
 
803 aa  65.1  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  23.6 
 
 
407 aa  63.9  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.5 
 
 
761 aa  63.9  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  23.91 
 
 
611 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4222  glycoside hydrolase 15-related protein  24.08 
 
 
484 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  24.03 
 
 
592 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  20.51 
 
 
632 aa  62  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  24.03 
 
 
592 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  23.74 
 
 
487 aa  61.2  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  23.81 
 
 
870 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.32 
 
 
802 aa  60.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  24.2 
 
 
596 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  24.8 
 
 
472 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2413  glycoside hydrolase 15-related  23.66 
 
 
412 aa  58.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0219  glycoside hydrolase 15-related  22 
 
 
402 aa  58.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0997463  hitchhiker  0.0053447 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  22.7 
 
 
619 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  23.97 
 
 
609 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  19.8 
 
 
869 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.97 
 
 
800 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  20.57 
 
 
621 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  19.55 
 
 
608 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  22.03 
 
 
617 aa  55.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  20.71 
 
 
618 aa  54.3  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  22.43 
 
 
599 aa  54.3  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  21.47 
 
 
636 aa  53.9  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  19.13 
 
 
608 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.17 
 
 
803 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  21.09 
 
 
598 aa  53.5  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  22.73 
 
 
595 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.9 
 
 
798 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  23.43 
 
 
599 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.99 
 
 
1505 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  23.2 
 
 
609 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31600  glycosyl hydrolase, glucoamylase  25.77 
 
 
549 aa  52.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  20.58 
 
 
625 aa  52.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  21.14 
 
 
640 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0989  glycoside hydrolase 15-related  22.91 
 
 
583 aa  51.2  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.422576  normal  0.0726488 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.27 
 
 
692 aa  51.2  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.27 
 
 
681 aa  51.2  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5525  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.1 
 
 
463 aa  51.2  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  23.96 
 
 
867 aa  51.2  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  21.78 
 
 
594 aa  50.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  19.78 
 
 
623 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.78 
 
 
821 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  20.22 
 
 
605 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  19.96 
 
 
596 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  21.01 
 
 
814 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  19.29 
 
 
657 aa  49.3  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  23.16 
 
 
835 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  20.76 
 
 
603 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0405  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.32 
 
 
477 aa  49.7  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.878783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  21.21 
 
 
598 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  19.2 
 
 
599 aa  48.9  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  24.05 
 
 
620 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.38 
 
 
786 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  22.38 
 
 
786 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  19.49 
 
 
610 aa  48.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  20.75 
 
 
624 aa  48.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  21.2 
 
 
597 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  21.27 
 
 
606 aa  48.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  21.27 
 
 
606 aa  48.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  21.45 
 
 
786 aa  47.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  20.49 
 
 
606 aa  47.4  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  19.21 
 
 
625 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  21.56 
 
 
597 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4565  glycoside hydrolase 15-related protein  21.39 
 
 
623 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>