212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1787 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  54.19 
 
 		 644 aa  740    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 644 aa  1338    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  35.84 
 
 		 642 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  32.52 
 
 		 611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  32.85 
 
 		 673 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  29.91 
 
 		 621 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  29.31 
 
 		 621 aa  297  4e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  29.76 
 
 		 621 aa  295  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  30.03 
 
 		 627 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  29.19 
 
 		 604 aa  282  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  28.1 
 
 		 621 aa  280  8e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  32.74 
 
 		 663 aa  276  9e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  32.21 
 
 		 647 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  28.91 
 
 		 668 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  30.12 
 
 		 650 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  26.81 
 
 		 647 aa  251  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  28.18 
 
 		 670 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  26.84 
 
 		 645 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  26.53 
 
 		 622 aa  227  6e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  26.59 
 
 		 649 aa  221  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  26.57 
 
 		 615 aa  212  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  27.31 
 
 		 615 aa  205  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.88 
 
 		 569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  23.97 
 
 		 602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  27.4 
 
 		 363 aa  135  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  23.44 
 
 		 610 aa  130  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  26.14 
 
 		 622 aa  120  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  25.71 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.34 
 
 		 1505 aa  99  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  24.49 
 
 		 584 aa  94.4  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.83 
 
 		 802 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.59 
 
 		 803 aa  82  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  23.17 
 
 		 611 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  25.28 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  21.29 
 
 		 870 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  24.89 
 
 		 593 aa  77  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4631  glycoside hydrolase 15-related  33.8 
 
 		 386 aa  77  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  23.59 
 
 		 592 aa  71.6  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  23.63 
 
 		 596 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  24.3 
 
 		 645 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  23.34 
 
 		 592 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2413  glycoside hydrolase 15-related  25.9 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  25.63 
 
 		 597 aa  68.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0554  glycoside hydrolase 15-related protein  21.21 
 
 		 578 aa  68.6  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000579959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  22.59 
 
 		 636 aa  68.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  22.03 
 
 		 625 aa  68.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  24.54 
 
 		 597 aa  68.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  23.46 
 
 		 1592 aa  67.4  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0545  glucan 14-alpha-glucosidase  24.14 
 
 		 734 aa  66.6  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  24.5 
 
 		 599 aa  67  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  23.79 
 
 		 592 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  22.58 
 
 		 589 aa  66.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  21.35 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1144  glycoside hydrolase 15-related protein  21.18 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2647  Glucoamylase and related glycosyl hydrolase- like protein  23.31 
 
 		 683 aa  64.3  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  21.35 
 
 		 605 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  21.01 
 
 		 627 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  24.03 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.18 
 
 		 761 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  24.09 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  21.19 
 
 		 598 aa  62  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1322  glycoside hydrolase 15-related  23.27 
 
 		 565 aa  62  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.033472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  23.7 
 
 		 844 aa  60.8  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  22.02 
 
 		 850 aa  60.8  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  21.73 
 
 		 621 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  22.38 
 
 		 593 aa  60.5  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.23 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  22.03 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  23.9 
 
 		 626 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  22.51 
 
 		 645 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  23.41 
 
 		 600 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31600  glycosyl hydrolase, glucoamylase  30.14 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.67 
 
 		 800 aa  58.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  21.78 
 
 		 893 aa  58.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  23.05 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.32 
 
 		 798 aa  57.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  20.88 
 
 		 632 aa  57.4  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.06 
 
 		 801 aa  57.4  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  24.03 
 
 		 600 aa  57.4  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  24.53 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  23.25 
 
 		 598 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  23.06 
 
 		 598 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0989  glycoside hydrolase 15-related  20.62 
 
 		 583 aa  56.6  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.422576  normal  0.0726488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0219  glycoside hydrolase 15-related  24.26 
 
 		 402 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0997463  hitchhiker  0.0053447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  22.98 
 
 		 616 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  22.58 
 
 		 876 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  21.6 
 
 		 867 aa  56.2  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  21.01 
 
 		 627 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  22.7 
 
 		 786 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  24.39 
 
 		 594 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  24.3 
 
 		 629 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  21.57 
 
 		 596 aa  55.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  20.12 
 
 		 617 aa  55.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  22.27 
 
 		 613 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.6 
 
 		 820 aa  54.7  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  22.12 
 
 		 597 aa  54.7  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  21.71 
 
 		 603 aa  54.7  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  22.58 
 
 		 677 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  22.58 
 
 		 677 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  23.7 
 
 		 487 aa  54.3  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>