212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1778 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
598 aa  1223    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  62.54 
 
 
594 aa  770    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  53.45 
 
 
599 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  52.69 
 
 
598 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  65.38 
 
 
598 aa  809    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  54.85 
 
 
603 aa  672    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  52.27 
 
 
624 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  53.98 
 
 
593 aa  629  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  52.86 
 
 
598 aa  624  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  52.01 
 
 
596 aa  625  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  51.85 
 
 
593 aa  621  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  52.69 
 
 
606 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  52.96 
 
 
592 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  51.18 
 
 
657 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  52.19 
 
 
640 aa  609  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  49.66 
 
 
589 aa  610  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  51.85 
 
 
606 aa  610  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  51.35 
 
 
606 aa  610  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  52.36 
 
 
618 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  51.35 
 
 
620 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  50.77 
 
 
595 aa  600  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  50.08 
 
 
595 aa  587  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  48.9 
 
 
597 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  48.06 
 
 
597 aa  550  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  38.91 
 
 
593 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  37.12 
 
 
593 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  37.73 
 
 
594 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  31.76 
 
 
625 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  33.22 
 
 
595 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  32.17 
 
 
629 aa  270  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  34.06 
 
 
611 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  34.23 
 
 
609 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  34.11 
 
 
596 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  32 
 
 
613 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  33.66 
 
 
609 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  33.66 
 
 
609 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  33 
 
 
605 aa  267  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  33.72 
 
 
609 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  33.5 
 
 
609 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  32.45 
 
 
599 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  33.11 
 
 
609 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  32.22 
 
 
605 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  31.93 
 
 
628 aa  260  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  31.69 
 
 
627 aa  259  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  32.35 
 
 
613 aa  259  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  32.95 
 
 
586 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  33.22 
 
 
626 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  32.66 
 
 
876 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  31.78 
 
 
893 aa  258  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  31.73 
 
 
786 aa  257  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  32.38 
 
 
623 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  31.47 
 
 
850 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  31.65 
 
 
614 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  31.61 
 
 
596 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  33 
 
 
611 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  32.35 
 
 
602 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  32.73 
 
 
600 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  32.35 
 
 
602 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  31.93 
 
 
610 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  31.93 
 
 
610 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  31.95 
 
 
627 aa  252  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  32.13 
 
 
626 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  31.93 
 
 
610 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  31.93 
 
 
610 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  31.93 
 
 
610 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  31.93 
 
 
610 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  31.93 
 
 
610 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  31.22 
 
 
612 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  31.61 
 
 
597 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  32.12 
 
 
599 aa  251  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  32.45 
 
 
610 aa  251  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  30.76 
 
 
894 aa  251  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  32.9 
 
 
635 aa  251  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  31.85 
 
 
600 aa  251  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  31.4 
 
 
867 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  31.45 
 
 
598 aa  250  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  30.54 
 
 
612 aa  250  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  31.85 
 
 
602 aa  250  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  31.03 
 
 
627 aa  249  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  31.1 
 
 
623 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  31.57 
 
 
617 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  32.53 
 
 
619 aa  248  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  30.49 
 
 
842 aa  248  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  31.79 
 
 
627 aa  248  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  31.18 
 
 
867 aa  248  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  32.39 
 
 
601 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  31.65 
 
 
619 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  32.08 
 
 
612 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  31.54 
 
 
601 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  31.14 
 
 
625 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  31.72 
 
 
596 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  32.5 
 
 
598 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  31.7 
 
 
602 aa  244  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  31.61 
 
 
605 aa  243  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  32.33 
 
 
593 aa  242  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  31.61 
 
 
665 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  31.99 
 
 
594 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  30.65 
 
 
599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  31.89 
 
 
610 aa  240  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  31.51 
 
 
597 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>