220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1528 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  53.89 
 
 
596 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  61.69 
 
 
603 aa  765    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  65.49 
 
 
624 aa  806    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  55.44 
 
 
593 aa  647    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  61.79 
 
 
618 aa  752    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  54.97 
 
 
599 aa  672    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  66.39 
 
 
620 aa  818    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
593 aa  1226    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  55.22 
 
 
589 aa  666    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  63.24 
 
 
640 aa  781    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  63.01 
 
 
657 aa  771    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  64.02 
 
 
606 aa  787    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  61.49 
 
 
606 aa  754    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  53.11 
 
 
595 aa  639    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  64.08 
 
 
598 aa  789    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  61.49 
 
 
606 aa  754    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  52.45 
 
 
598 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  52.61 
 
 
595 aa  629  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  51.26 
 
 
598 aa  628  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  53.14 
 
 
592 aa  619  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  51.85 
 
 
598 aa  621  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  50.08 
 
 
594 aa  605  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  48.56 
 
 
597 aa  569  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  48.56 
 
 
597 aa  568  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  39.8 
 
 
593 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  39.29 
 
 
593 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  37.93 
 
 
594 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  36.65 
 
 
586 aa  333  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  35.53 
 
 
613 aa  314  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  34.85 
 
 
625 aa  312  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  35.12 
 
 
596 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  35.19 
 
 
601 aa  310  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  34.97 
 
 
599 aa  309  8e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  33.88 
 
 
605 aa  309  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  34.93 
 
 
597 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  34.71 
 
 
627 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  34.93 
 
 
602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  33.95 
 
 
596 aa  306  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  34.06 
 
 
600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  34.39 
 
 
599 aa  304  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  34.93 
 
 
850 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  33.39 
 
 
611 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  33.89 
 
 
609 aa  300  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  35.74 
 
 
617 aa  299  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  34.85 
 
 
629 aa  299  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  33.39 
 
 
609 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  33.22 
 
 
612 aa  296  7e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  33.39 
 
 
609 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  34.04 
 
 
628 aa  296  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  33.72 
 
 
601 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  33.5 
 
 
613 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  31.9 
 
 
677 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  31.9 
 
 
677 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  32.62 
 
 
598 aa  294  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  33.22 
 
 
609 aa  294  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  35.14 
 
 
602 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  31.9 
 
 
677 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  35.14 
 
 
602 aa  293  9e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  33.82 
 
 
623 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  33.82 
 
 
623 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  33.06 
 
 
609 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  32.88 
 
 
602 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  33.28 
 
 
605 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  32.89 
 
 
611 aa  290  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  34.27 
 
 
598 aa  290  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  33.84 
 
 
609 aa  290  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  32.95 
 
 
594 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  34.67 
 
 
611 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  34.39 
 
 
602 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  31.9 
 
 
672 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  32.4 
 
 
610 aa  287  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  32.33 
 
 
595 aa  286  7e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  33.88 
 
 
645 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  33.28 
 
 
619 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  32.95 
 
 
612 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  32.15 
 
 
619 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  32.35 
 
 
605 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  33.5 
 
 
610 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  34.4 
 
 
616 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  32.32 
 
 
659 aa  282  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  33.5 
 
 
610 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  33.5 
 
 
610 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  33.5 
 
 
610 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  33.5 
 
 
610 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  33.5 
 
 
610 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  33.5 
 
 
610 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  33.45 
 
 
600 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  32.16 
 
 
593 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  31.48 
 
 
668 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  31.93 
 
 
642 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  32.78 
 
 
629 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  32.24 
 
 
645 aa  280  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  32.38 
 
 
867 aa  279  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  33.56 
 
 
596 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  31.23 
 
 
606 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  30.82 
 
 
612 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  31.95 
 
 
602 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  32.95 
 
 
601 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  32.33 
 
 
600 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  32.12 
 
 
608 aa  277  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>