218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1504 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  52.34 
 
 		 603 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 594 aa  1215    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  62.54 
 
 		 598 aa  770    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  74.41 
 
 		 598 aa  902    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  52.63 
 
 		 599 aa  621  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  51.01 
 
 		 624 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  49.15 
 
 		 589 aa  609  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  51.19 
 
 		 620 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  50.08 
 
 		 593 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  50.68 
 
 		 606 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  51.77 
 
 		 598 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  50 
 
 		 618 aa  598  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  51.1 
 
 		 640 aa  598  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  49.41 
 
 		 596 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  50.51 
 
 		 657 aa  591  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  50.34 
 
 		 606 aa  588  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  50.34 
 
 		 606 aa  588  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  49.75 
 
 		 598 aa  586  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  50.26 
 
 		 595 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  51.45 
 
 		 593 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  50.17 
 
 		 592 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  48.31 
 
 		 595 aa  558  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  47.53 
 
 		 597 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  46.85 
 
 		 597 aa  534  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  36.13 
 
 		 593 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  37.1 
 
 		 593 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  34.48 
 
 		 594 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  35.24 
 
 		 596 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  33.28 
 
 		 625 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  34.05 
 
 		 586 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  34.82 
 
 		 613 aa  277  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  33.83 
 
 		 627 aa  276  5e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  32.94 
 
 		 599 aa  276  7e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  33.11 
 
 		 626 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  34.12 
 
 		 594 aa  273  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  33.95 
 
 		 595 aa  272  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  33.11 
 
 		 597 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  32.45 
 
 		 598 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  32.89 
 
 		 594 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  34 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  33 
 
 		 605 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  34 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  34 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  34 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  34 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  34 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  32.94 
 
 		 601 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  34.72 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  34.33 
 
 		 609 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  34.33 
 
 		 609 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  34 
 
 		 626 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  33.17 
 
 		 602 aa  267  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  34.49 
 
 		 609 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  34.27 
 
 		 609 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  31.93 
 
 		 611 aa  266  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  33.94 
 
 		 609 aa  266  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  34.16 
 
 		 609 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  34.6 
 
 		 611 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  34.4 
 
 		 629 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  33.11 
 
 		 876 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  33 
 
 		 605 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  34 
 
 		 842 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  34.98 
 
 		 608 aa  263  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  34.59 
 
 		 627 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  33.5 
 
 		 600 aa  263  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  32.44 
 
 		 602 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  31.73 
 
 		 612 aa  262  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  33.16 
 
 		 594 aa  262  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  32.02 
 
 		 605 aa  262  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  33.22 
 
 		 599 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  33.11 
 
 		 598 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  32.82 
 
 		 600 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  33.22 
 
 		 867 aa  259  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  32.31 
 
 		 602 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  33.67 
 
 		 617 aa  259  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  33.44 
 
 		 620 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  32.44 
 
 		 893 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  31.87 
 
 		 613 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  32.95 
 
 		 867 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  34.42 
 
 		 628 aa  257  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  33.39 
 
 		 619 aa  257  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 623 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  33.39 
 
 		 619 aa  256  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  32.51 
 
 		 610 aa  256  9e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  31.97 
 
 		 602 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  32.31 
 
 		 599 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  33.17 
 
 		 629 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  32.67 
 
 		 786 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  33.94 
 
 		 665 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 635 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  33 
 
 		 601 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  31.79 
 
 		 626 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  31.62 
 
 		 598 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  33.94 
 
 		 613 aa  253  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 		 593 aa  253  6e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  32.43 
 
 		 601 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  33.39 
 
 		 600 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  32.27 
 
 		 611 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  32.02 
 
 		 614 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>