214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4023 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 593 aa  1246    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  56.59 
 
 		 593 aa  701    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  74.66 
 
 		 594 aa  966    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  40 
 
 		 624 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  40.03 
 
 		 606 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  39.8 
 
 		 593 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  40.65 
 
 		 595 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  39.87 
 
 		 598 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  39.23 
 
 		 640 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  39.66 
 
 		 620 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  37.94 
 
 		 657 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  39.09 
 
 		 596 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  39.7 
 
 		 595 aa  432  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  38.14 
 
 		 599 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  37.29 
 
 		 598 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  39.23 
 
 		 606 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  39.23 
 
 		 606 aa  425  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  39.09 
 
 		 593 aa  422  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  37.77 
 
 		 603 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  38.99 
 
 		 618 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  36.09 
 
 		 589 aa  418  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  38.91 
 
 		 598 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  39.15 
 
 		 592 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  37.76 
 
 		 597 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  37.41 
 
 		 597 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  36.46 
 
 		 598 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  36.13 
 
 		 594 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  33.39 
 
 		 611 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  32.79 
 
 		 612 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  33.5 
 
 		 612 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  32.78 
 
 		 602 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  32.78 
 
 		 602 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  31.74 
 
 		 625 aa  301  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  32.77 
 
 		 596 aa  300  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  32.24 
 
 		 613 aa  297  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  31.86 
 
 		 599 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  31.79 
 
 		 600 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  32.54 
 
 		 586 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  33.61 
 
 		 868 aa  289  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  32.88 
 
 		 600 aa  289  9e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  31.89 
 
 		 599 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  31.4 
 
 		 606 aa  287  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  32.89 
 
 		 610 aa  287  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  32.78 
 
 		 645 aa  286  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  31.23 
 
 		 598 aa  286  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  31.69 
 
 		 610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  31.69 
 
 		 610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  32.72 
 
 		 596 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  31.69 
 
 		 610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  31.69 
 
 		 610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  31.69 
 
 		 610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  31.69 
 
 		 610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  31.69 
 
 		 610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  30.68 
 
 		 629 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  31.89 
 
 		 627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  31.69 
 
 		 665 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  31.47 
 
 		 609 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  31.3 
 
 		 609 aa  282  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  31.59 
 
 		 619 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  31.62 
 
 		 677 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  31.62 
 
 		 677 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  31.53 
 
 		 609 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  32.07 
 
 		 642 aa  279  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  31.99 
 
 		 597 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  31.79 
 
 		 621 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  31.25 
 
 		 611 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  31.46 
 
 		 677 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  31.81 
 
 		 596 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  30.96 
 
 		 598 aa  277  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  31.7 
 
 		 601 aa  277  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  30.74 
 
 		 605 aa  276  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  31.14 
 
 		 623 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  30.42 
 
 		 603 aa  276  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  31.47 
 
 		 599 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  32.51 
 
 		 613 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  30.96 
 
 		 617 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  30.28 
 
 		 635 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  31.12 
 
 		 850 aa  274  3e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  30.73 
 
 		 609 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  30.73 
 
 		 609 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  31.92 
 
 		 629 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  32.17 
 
 		 602 aa  273  9e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  31.01 
 
 		 623 aa  273  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  29.97 
 
 		 627 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  30.8 
 
 		 609 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  31.41 
 
 		 617 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  32.5 
 
 		 645 aa  271  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  29.83 
 
 		 594 aa  270  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  31.09 
 
 		 593 aa  269  8.999999999999999e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  32.04 
 
 		 623 aa  269  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  30.27 
 
 		 605 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  31.81 
 
 		 625 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  30.6 
 
 		 627 aa  269  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  31.4 
 
 		 602 aa  269  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  30.38 
 
 		 636 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  31.87 
 
 		 628 aa  267  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  31.61 
 
 		 609 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  30.52 
 
 		 594 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  29.93 
 
 		 595 aa  266  7e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  30.32 
 
 		 602 aa  266  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>