24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2647 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1149  glucan 14-alpha-glucosidase  65.32 
 
 
715 aa  864    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2647  Glucoamylase and related glycosyl hydrolase- like protein  100 
 
 
683 aa  1345    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0545  glucan 14-alpha-glucosidase  50.35 
 
 
734 aa  605  9.999999999999999e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495812  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  49.14 
 
 
1505 aa  553  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  42.51 
 
 
1592 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  23.62 
 
 
673 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  25.91 
 
 
647 aa  94  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  24.63 
 
 
615 aa  90.9  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  25.78 
 
 
642 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  23.75 
 
 
644 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  25.56 
 
 
604 aa  67.8  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  27.66 
 
 
668 aa  65.1  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  23.29 
 
 
627 aa  63.9  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  24.27 
 
 
611 aa  63.9  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  24.25 
 
 
644 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  26.34 
 
 
622 aa  62  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  27.2 
 
 
615 aa  61.2  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  27.72 
 
 
663 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  20.8 
 
 
621 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  22.56 
 
 
621 aa  52.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  23.48 
 
 
645 aa  52.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  20.7 
 
 
621 aa  50.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  26.2 
 
 
650 aa  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  21.19 
 
 
621 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>