154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0335 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 644 aa  1342    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  54.19 
 
 		 644 aa  740    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  35.57 
 
 		 642 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  32.92 
 
 		 611 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  29.93 
 
 		 673 aa  289  9e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  30 
 
 		 604 aa  272  1e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  28.35 
 
 		 621 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  28.57 
 
 		 621 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  27.59 
 
 		 621 aa  257  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  28.44 
 
 		 663 aa  250  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  28.12 
 
 		 621 aa  249  9e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  28.12 
 
 		 647 aa  242  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  26.74 
 
 		 670 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  27.88 
 
 		 647 aa  231  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  28.08 
 
 		 627 aa  228  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  28.51 
 
 		 650 aa  226  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.24 
 
 		 569 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  28.18 
 
 		 649 aa  219  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  27.19 
 
 		 615 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  26.52 
 
 		 645 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  25.7 
 
 		 668 aa  209  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  25.64 
 
 		 622 aa  206  9e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  25.85 
 
 		 615 aa  185  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  28.12 
 
 		 363 aa  137  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  25.51 
 
 		 602 aa  134  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  27.42 
 
 		 610 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  27.36 
 
 		 622 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  25.3 
 
 		 407 aa  105  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.22 
 
 		 1505 aa  97.8  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  24.3 
 
 		 472 aa  87  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.47489 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  23.27 
 
 		 584 aa  82  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.3 
 
 		 802 aa  80.9  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.62 
 
 		 803 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4631  glycoside hydrolase 15-related  25.06 
 
 		 386 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  21.61 
 
 		 870 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  23.18 
 
 		 1592 aa  70.5  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.06 
 
 		 715 aa  69.7  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  21.78 
 
 		 621 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  22.54 
 
 		 611 aa  67.4  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4222  glycoside hydrolase 15-related protein  23.83 
 
 		 484 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  21.41 
 
 		 589 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0545  glucan 14-alpha-glucosidase  23.06 
 
 		 734 aa  65.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  22.12 
 
 		 625 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0554  glycoside hydrolase 15-related protein  23.45 
 
 		 578 aa  63.9  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000579959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2413  glycoside hydrolase 15-related  25.61 
 
 		 412 aa  63.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0219  glycoside hydrolase 15-related  22.43 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0997463  hitchhiker  0.0053447 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  23.11 
 
 		 592 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  23.6 
 
 		 592 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.36 
 
 		 761 aa  60.8  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2647  Glucoamylase and related glycosyl hydrolase- like protein  23.43 
 
 		 683 aa  60.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1149  glucan 14-alpha-glucosidase  22.99 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  21.28 
 
 		 596 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.22 
 
 		 800 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  22.95 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.62 
 
 		 801 aa  58.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.49 
 
 		 814 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  24.35 
 
 		 487 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  22.95 
 
 		 611 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  22.71 
 
 		 609 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  23.37 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  23.37 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  24.91 
 
 		 599 aa  55.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.91 
 
 		 820 aa  55.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  23.37 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  23.37 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  23.37 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  23.37 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  23.37 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  23.06 
 
 		 672 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  23.17 
 
 		 867 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  22.46 
 
 		 609 aa  55.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  21.68 
 
 		 595 aa  54.3  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  20.65 
 
 		 594 aa  54.3  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  21.26 
 
 		 620 aa  53.9  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  21.95 
 
 		 598 aa  53.5  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1322  glycoside hydrolase 15-related  22.27 
 
 		 565 aa  53.5  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.033472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  21.33 
 
 		 599 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  22.89 
 
 		 609 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  22.89 
 
 		 609 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  21.38 
 
 		 632 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  22.17 
 
 		 835 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31600  glycosyl hydrolase, glucoamylase  30 
 
 		 549 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  22.89 
 
 		 609 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  24.28 
 
 		 592 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  22.2 
 
 		 595 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1144  glycoside hydrolase 15-related protein  20.5 
 
 		 696 aa  51.6  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  22.84 
 
 		 844 aa  51.6  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  23.86 
 
 		 593 aa  51.2  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  22.12 
 
 		 602 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  21.71 
 
 		 600 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  21.61 
 
 		 597 aa  50.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  21.38 
 
 		 593 aa  50.8  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  23.41 
 
 		 867 aa  50.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  22.12 
 
 		 602 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  21.48 
 
 		 645 aa  50.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  20.98 
 
 		 605 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  21.46 
 
 		 668 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  27.72 
 
 		 619 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  21.66 
 
 		 645 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  28.42 
 
 		 620 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>