66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1053 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 1505 aa  3022    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  48.44 
 
 		 1592 aa  1337    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2647  Glucoamylase and related glycosyl hydrolase- like protein  49.14 
 
 		 683 aa  545  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1149  glucan 14-alpha-glucosidase  46.54 
 
 		 715 aa  531  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0545  glucan 14-alpha-glucosidase  43.37 
 
 		 734 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  36.98 
 
 		 715 aa  403  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  32.61 
 
 		 1160 aa  332  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.55 
 
 		 814 aa  284  9e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.87 
 
 		 858 aa  280  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.87 
 
 		 858 aa  280  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.73 
 
 		 692 aa  278  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.73 
 
 		 681 aa  278  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.67 
 
 		 858 aa  278  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.9 
 
 		 801 aa  276  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  37.67 
 
 		 1132 aa  276  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.01 
 
 		 838 aa  268  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  28.95 
 
 		 881 aa  267  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  30.18 
 
 		 847 aa  266  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.51 
 
 		 821 aa  265  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.74 
 
 		 841 aa  264  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.77 
 
 		 837 aa  263  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.31 
 
 		 882 aa  262  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.21 
 
 		 808 aa  262  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.21 
 
 		 808 aa  262  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  28.35 
 
 		 881 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.57 
 
 		 820 aa  261  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  28.42 
 
 		 882 aa  260  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.69 
 
 		 802 aa  260  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.84 
 
 		 840 aa  258  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.82 
 
 		 803 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.96 
 
 		 761 aa  252  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.06 
 
 		 817 aa  252  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.84 
 
 		 803 aa  251  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.15 
 
 		 838 aa  251  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.48 
 
 		 800 aa  248  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.95 
 
 		 833 aa  247  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.21 
 
 		 786 aa  244  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  29.21 
 
 		 786 aa  244  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.25 
 
 		 860 aa  243  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.96 
 
 		 777 aa  242  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  31.02 
 
 		 835 aa  243  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.95 
 
 		 798 aa  228  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.33 
 
 		 433 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  31.73 
 
 		 647 aa  122  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  25.8 
 
 		 644 aa  104  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  28.37 
 
 		 673 aa  101  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  26.68 
 
 		 644 aa  101  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  27.67 
 
 		 642 aa  99.8  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  27.07 
 
 		 604 aa  82  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  25.94 
 
 		 615 aa  78.6  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  24 
 
 		 611 aa  77.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  25.06 
 
 		 647 aa  74.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  30.83 
 
 		 650 aa  73.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  24.94 
 
 		 645 aa  72.8  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  27.39 
 
 		 668 aa  70.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  27.97 
 
 		 615 aa  70.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  25.06 
 
 		 627 aa  69.3  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  26.9 
 
 		 670 aa  61.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  27.97 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  24.23 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.82 
 
 		 430 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  23.99 
 
 		 621 aa  57.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  24.49 
 
 		 621 aa  55.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.82 
 
 		 569 aa  48.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  23.74 
 
 		 622 aa  47.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48530  phosphate regulon histidine protein kinase; PhoR  35.96 
 
 		 440 aa  45.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.771609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>