51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2349 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 
433 aa  895    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  96.54 
 
 
858 aa  875    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  72.54 
 
 
840 aa  658    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  97.23 
 
 
858 aa  878    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  97.23 
 
 
858 aa  878    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  75.58 
 
 
833 aa  691    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  87.96 
 
 
837 aa  808    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  72.69 
 
 
820 aa  651    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  87.27 
 
 
838 aa  784    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  88.19 
 
 
838 aa  810    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  71.98 
 
 
841 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  85.19 
 
 
847 aa  782    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  69.01 
 
 
817 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  58.04 
 
 
821 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  59.16 
 
 
803 aa  504  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  56.48 
 
 
860 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  54.94 
 
 
808 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  54.94 
 
 
808 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  56.31 
 
 
777 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.27 
 
 
715 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.81 
 
 
814 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  32.35 
 
 
1592 aa  210  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.63 
 
 
1505 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  33.19 
 
 
881 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.41 
 
 
801 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  33.92 
 
 
881 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  33.92 
 
 
882 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.92 
 
 
882 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31 
 
 
803 aa  180  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  33.57 
 
 
1160 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31 
 
 
802 aa  176  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.64 
 
 
800 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.57 
 
 
692 aa  170  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.57 
 
 
681 aa  170  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.35 
 
 
1132 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  31.35 
 
 
835 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.71 
 
 
761 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.9 
 
 
798 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.59 
 
 
786 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  27.59 
 
 
786 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  30.1 
 
 
670 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  28.14 
 
 
615 aa  67  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  26.26 
 
 
645 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  25.75 
 
 
649 aa  56.6  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  22.78 
 
 
615 aa  50.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  24.12 
 
 
647 aa  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.68 
 
 
569 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  24.89 
 
 
668 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  23.5 
 
 
627 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  24.35 
 
 
621 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  24.24 
 
 
663 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>