252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1916 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 569 aa  1184    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  63.13 
 
 		 649 aa  753    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  41.35 
 
 		 668 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  38.03 
 
 		 670 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  35.4 
 
 		 645 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  34.73 
 
 		 647 aa  342  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  37.39 
 
 		 663 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  35.45 
 
 		 615 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  35.22 
 
 		 650 aa  302  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  30.42 
 
 		 622 aa  273  7e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  32.74 
 
 		 615 aa  268  2.9999999999999995e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  28.24 
 
 		 644 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  28.22 
 
 		 642 aa  206  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  26.88 
 
 		 644 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  26.43 
 
 		 621 aa  182  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  27.38 
 
 		 673 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  28.15 
 
 		 647 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  26.42 
 
 		 621 aa  180  8e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  27.22 
 
 		 604 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  26.24 
 
 		 627 aa  171  3e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  26.06 
 
 		 621 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  27.64 
 
 		 611 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  25.68 
 
 		 621 aa  166  9e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  27.83 
 
 		 602 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  26.77 
 
 		 584 aa  104  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  25.31 
 
 		 610 aa  100  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  27 
 
 		 595 aa  99  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  26.34 
 
 		 597 aa  97.1  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  26.67 
 
 		 597 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  26.36 
 
 		 622 aa  94  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  25.96 
 
 		 596 aa  93.6  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  26.88 
 
 		 586 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  26.29 
 
 		 595 aa  90.9  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  29.26 
 
 		 636 aa  89.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  26.05 
 
 		 594 aa  87.8  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  27.91 
 
 		 592 aa  87.8  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  24.36 
 
 		 619 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  25.43 
 
 		 363 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  24.78 
 
 		 599 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  24.33 
 
 		 596 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  26.04 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  27.61 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  29.81 
 
 		 672 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  25.31 
 
 		 636 aa  84.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  24.77 
 
 		 598 aa  84  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  23.85 
 
 		 619 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  30.99 
 
 		 629 aa  84  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  23.82 
 
 		 593 aa  84  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  23.17 
 
 		 595 aa  83.6  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  30.62 
 
 		 642 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  24.23 
 
 		 620 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  23.88 
 
 		 609 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  24.47 
 
 		 599 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  24.21 
 
 		 611 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  24.2 
 
 		 594 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  23.82 
 
 		 609 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  23.82 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1640  glycoside hydrolase 15-related  29.29 
 
 		 887 aa  80.5  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  23.82 
 
 		 609 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  24.63 
 
 		 596 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  28.24 
 
 		 596 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  26.11 
 
 		 617 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1092  glycoside hydrolase 15-related  32.07 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.281336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  23.82 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  23.82 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  23.82 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  24.73 
 
 		 598 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  29.05 
 
 		 677 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  24.87 
 
 		 611 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  28.57 
 
 		 677 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  30.77 
 
 		 589 aa  78.2  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  28.57 
 
 		 677 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  24.64 
 
 		 629 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  23.47 
 
 		 593 aa  77.8  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  25.75 
 
 		 610 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 610 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  23.31 
 
 		 613 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  25.75 
 
 		 610 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  25.75 
 
 		 610 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  25.75 
 
 		 610 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  25.75 
 
 		 610 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  25.75 
 
 		 610 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  27.83 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  27.52 
 
 		 727 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  24.52 
 
 		 617 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  26.3 
 
 		 599 aa  76.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  25.43 
 
 		 602 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  30.18 
 
 		 603 aa  76.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  22.94 
 
 		 610 aa  76.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  27.94 
 
 		 894 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  28.78 
 
 		 679 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  22.63 
 
 		 605 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0980  glycoside hydrolase 15-related  29.89 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  34.09 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  23.91 
 
 		 626 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  23.29 
 
 		 611 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  28.23 
 
 		 668 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  24.19 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  23.43 
 
 		 606 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  23.43 
 
 		 606 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>