54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1626 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
622 aa  1247    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  26.41 
 
 
870 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  27.78 
 
 
647 aa  120  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  26.14 
 
 
644 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  27.72 
 
 
604 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  27.76 
 
 
621 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  26.58 
 
 
621 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  27.36 
 
 
644 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  26.2 
 
 
621 aa  113  9e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  27.99 
 
 
642 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  26.55 
 
 
621 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  26.22 
 
 
627 aa  99.4  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  27.36 
 
 
670 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  24.06 
 
 
622 aa  94  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.36 
 
 
569 aa  93.6  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  26.8 
 
 
668 aa  92.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  27.05 
 
 
663 aa  90.5  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  26.49 
 
 
611 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  23.93 
 
 
645 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  24.44 
 
 
615 aa  80.5  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  24.71 
 
 
649 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  23.18 
 
 
610 aa  73.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  23.36 
 
 
615 aa  72.4  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  35.95 
 
 
650 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  23.3 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  23.49 
 
 
673 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  22.64 
 
 
602 aa  60.8  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  24.47 
 
 
647 aa  56.2  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  30.1 
 
 
349 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  20.75 
 
 
609 aa  50.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  20.75 
 
 
609 aa  50.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4222  glycoside hydrolase 15-related protein  22.15 
 
 
484 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.17 
 
 
761 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0554  glycoside hydrolase 15-related protein  23.63 
 
 
578 aa  49.7  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000579959  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0489  hypothetical protein  26.11 
 
 
435 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  20.41 
 
 
609 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  20.41 
 
 
609 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  20.75 
 
 
611 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  20.91 
 
 
609 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.33 
 
 
801 aa  48.9  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  26.67 
 
 
487 aa  47.4  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  19.48 
 
 
407 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0465  hypothetical protein  25.82 
 
 
435 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  22.86 
 
 
610 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  22.86 
 
 
610 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  22.86 
 
 
610 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  24.72 
 
 
867 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  22.86 
 
 
610 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  22.86 
 
 
610 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  22.86 
 
 
610 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  22.86 
 
 
610 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0219  glycoside hydrolase 15-related  31.63 
 
 
402 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0997463  hitchhiker  0.0053447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  20.57 
 
 
609 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  22.98 
 
 
594 aa  44.3  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>