31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0489 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0489  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  906    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0465  hypothetical protein  98.85 
 
 		 435 aa  895    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02630  glucan 1,4-alpha-glucosidase, putative  29.88 
 
 		 577 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33726  Glucoamylase GLU1 precursor (Glucan 1,4-alpha-glucosidase) (1,4-alpha-D-glucan glucohydrolase)  29.37 
 
 		 560 aa  169  6e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.259511 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  29.58 
 
 		 619 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  27.33 
 
 		 661 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0405  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.2 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.878783 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5525  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.93 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3302  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.86 
 
 		 456 aa  110  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5985  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.35 
 
 		 480 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  27.8 
 
 		 621 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  27.8 
 
 		 621 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  27.07 
 
 		 621 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  24.87 
 
 		 622 aa  74.7  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  25.55 
 
 		 627 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  24.4 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  25.58 
 
 		 621 aa  62  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  25.11 
 
 		 668 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  22.59 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  24.79 
 
 		 670 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  24.22 
 
 		 663 aa  55.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  28.03 
 
 		 650 aa  53.9  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  21.7 
 
 		 604 aa  50.8  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  26.11 
 
 		 622 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.72 
 
 		 569 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  22.67 
 
 		 644 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  26.25 
 
 		 644 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  23.02 
 
 		 615 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  22.91 
 
 		 611 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  25.85 
 
 		 612 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  23.73 
 
 		 645 aa  43.9  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>