28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5525 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5525  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 463 aa  926    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0405  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  47.76 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.878783 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3302  glucan 1,4-alpha-glucosidase  46.94 
 
 		 456 aa  352  7e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0489  hypothetical protein  26.22 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0465  hypothetical protein  26.28 
 
 		 435 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  25.89 
 
 		 619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  27.91 
 
 		 661 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33726  Glucoamylase GLU1 precursor (Glucan 1,4-alpha-glucosidase) (1,4-alpha-D-glucan glucohydrolase)  25.67 
 
 		 560 aa  98.2  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02630  glucan 1,4-alpha-glucosidase, putative  24.8 
 
 		 577 aa  98.2  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5985  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.33 
 
 		 480 aa  73.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  25.52 
 
 		 621 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  23.15 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  26.25 
 
 		 615 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  23.19 
 
 		 670 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  25.41 
 
 		 621 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  23.23 
 
 		 622 aa  53.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  25 
 
 		 621 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  21.76 
 
 		 644 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  24.49 
 
 		 673 aa  50.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.98 
 
 		 569 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  24.89 
 
 		 621 aa  47.4  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  25.16 
 
 		 663 aa  47.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  21.91 
 
 		 645 aa  47.4  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  24.14 
 
 		 627 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  22.27 
 
 		 668 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  24.92 
 
 		 650 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  24.27 
 
 		 647 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  26.43 
 
 		 604 aa  43.5  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>